Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARL3P36405 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARL3P36405 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARL3P36405 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARL3P36405 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARL3P36405 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARL3P36405 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ARL3P36405 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARL3P36405 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARL3P36405 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARL3P36405 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARL3P36405 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARL3P36405 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARL3P36405 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARL3P36405 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARL3P36405 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARL3P36405 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARL3P36405 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARL3P36405 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARL3P36405 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARL3P36405 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARL3P36405 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARL3P36405 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARL3P36405 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARL3P36405 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARL3P36405 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARL3P36405 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARL3P36405 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ARL3P36405 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARL3P36405 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ARL3P36405 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARL3P36405 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARL3P36405 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARL3P36405 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARL3P36405 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARL3P36405 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARL3P36405 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARL3P36405 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARL3P36405 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARL3P36405 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARL3P36405 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARL3P36405 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARL3P36405 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ARL3P36405 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ARL3P36405 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ARL3P36405 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ARL3P36405 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ARL3P36405 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ARL3P36405 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ARL3P36405 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ARL3P36405 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ARL3P36405 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ARL3P36405 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ARL3P36405 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ARL3P36405 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ARL3P36405 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ARL3P36405 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARL3P36405 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARL3P36405 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARL3P36405 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARL3P36405 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARL3P36405 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARL3P36405 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARL3P36405 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARL3P36405 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARL3P36405 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARL3P36405 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARL3P36405 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARL3P36405 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARL3P36405 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARL3P36405 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARL3P36405 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARL3P36405 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARL3P36405 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARL3P36405 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARL3P36405 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARL3P36405 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ARL3P36405 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARL3P36405 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARL3P36405 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARL3P36405 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARL3P36405 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARL3P36405 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARL3P36405 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARL3P36405 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ARL3P36405 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ARL3P36405 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ARL3P36405 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ARL3P36405 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ARL3P36405 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ARL3P36405 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ARL3P36405 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ARL3P36405 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ARL3P36405 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ARL3P36405 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ARL3P36405 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ARL3P36405 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ARL3P36405 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ARL3P36405 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ARL3P36405 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms