Protein–RNA interactions for Protein: P35520

CBS, Cystathionine beta-synthase, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSP35520 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CBSP35520 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CBSP35520 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CBSP35520 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CBSP35520 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CBSP35520 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CBSP35520 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CBSP35520 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CBSP35520 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CBSP35520 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CBSP35520 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CBSP35520 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CBSP35520 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CBSP35520 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CBSP35520 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CBSP35520 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CBSP35520 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CBSP35520 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CBSP35520 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CBSP35520 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CBSP35520 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CBSP35520 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CBSP35520 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CBSP35520 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CBSP35520 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CBSP35520 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CBSP35520 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CBSP35520 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CBSP35520 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CBSP35520 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CBSP35520 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CBSP35520 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CBSP35520 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CBSP35520 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CBSP35520 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBSP35520 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CBSP35520 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CBSP35520 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CBSP35520 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CBSP35520 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CBSP35520 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CBSP35520 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CBSP35520 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CBSP35520 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CBSP35520 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CBSP35520 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CBSP35520 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CBSP35520 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBSP35520 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CBSP35520 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CBSP35520 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CBSP35520 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBSP35520 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBSP35520 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBSP35520 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBSP35520 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CBSP35520 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBSP35520 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBSP35520 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CBSP35520 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CBSP35520 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CBSP35520 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBSP35520 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBSP35520 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBSP35520 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBSP35520 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBSP35520 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBSP35520 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBSP35520 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBSP35520 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBSP35520 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBSP35520 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBSP35520 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBSP35520 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBSP35520 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBSP35520 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBSP35520 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CBSP35520 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CBSP35520 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CBSP35520 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBSP35520 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBSP35520 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBSP35520 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBSP35520 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBSP35520 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBSP35520 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBSP35520 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBSP35520 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBSP35520 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBSP35520 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBSP35520 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBSP35520 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBSP35520 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBSP35520 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBSP35520 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CBSP35520 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CBSP35520 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBSP35520 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBSP35520 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CBSP35520 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms