Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXD13P35453 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXD13P35453 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXD13P35453 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXD13P35453 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXD13P35453 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXD13P35453 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXD13P35453 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXD13P35453 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXD13P35453 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXD13P35453 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXD13P35453 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXD13P35453 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXD13P35453 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXD13P35453 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXD13P35453 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXD13P35453 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXD13P35453 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXD13P35453 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXD13P35453 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXD13P35453 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXD13P35453 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXD13P35453 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXD13P35453 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXD13P35453 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXD13P35453 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXD13P35453 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HOXD13P35453 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXD13P35453 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXD13P35453 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXD13P35453 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXD13P35453 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXD13P35453 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXD13P35453 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXD13P35453 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXD13P35453 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXD13P35453 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXD13P35453 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXD13P35453 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXD13P35453 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXD13P35453 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXD13P35453 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXD13P35453 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXD13P35453 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXD13P35453 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXD13P35453 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXD13P35453 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXD13P35453 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXD13P35453 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXD13P35453 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXD13P35453 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXD13P35453 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXD13P35453 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXD13P35453 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXD13P35453 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXD13P35453 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXD13P35453 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXD13P35453 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXD13P35453 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXD13P35453 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXD13P35453 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXD13P35453 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXD13P35453 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXD13P35453 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXD13P35453 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXD13P35453 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXD13P35453 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXD13P35453 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXD13P35453 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXD13P35453 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXD13P35453 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
HOXD13P35453 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXD13P35453 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXD13P35453 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXD13P35453 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXD13P35453 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXD13P35453 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXD13P35453 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXD13P35453 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXD13P35453 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXD13P35453 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXD13P35453 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXD13P35453 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXD13P35453 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXD13P35453 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXD13P35453 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXD13P35453 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXD13P35453 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXD13P35453 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXD13P35453 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXD13P35453 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXD13P35453 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXD13P35453 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXD13P35453 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXD13P35453 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXD13P35453 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXD13P35453 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXD13P35453 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXD13P35453 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXD13P35453 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms