Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THBS4P35443 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THBS4P35443 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THBS4P35443 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THBS4P35443 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THBS4P35443 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THBS4P35443 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THBS4P35443 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THBS4P35443 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
THBS4P35443 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THBS4P35443 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THBS4P35443 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THBS4P35443 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
THBS4P35443 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
THBS4P35443 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
THBS4P35443 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
THBS4P35443 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
THBS4P35443 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THBS4P35443 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THBS4P35443 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THBS4P35443 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THBS4P35443 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THBS4P35443 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THBS4P35443 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THBS4P35443 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THBS4P35443 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THBS4P35443 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THBS4P35443 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THBS4P35443 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
THBS4P35443 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
THBS4P35443 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
THBS4P35443 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
THBS4P35443 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
THBS4P35443 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
THBS4P35443 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
THBS4P35443 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
THBS4P35443 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
THBS4P35443 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
THBS4P35443 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
THBS4P35443 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THBS4P35443 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THBS4P35443 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THBS4P35443 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THBS4P35443 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THBS4P35443 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THBS4P35443 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THBS4P35443 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THBS4P35443 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THBS4P35443 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THBS4P35443 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THBS4P35443 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THBS4P35443 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THBS4P35443 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THBS4P35443 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THBS4P35443 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THBS4P35443 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THBS4P35443 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THBS4P35443 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THBS4P35443 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THBS4P35443 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THBS4P35443 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THBS4P35443 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
THBS4P35443 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THBS4P35443 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THBS4P35443 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THBS4P35443 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THBS4P35443 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THBS4P35443 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THBS4P35443 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THBS4P35443 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THBS4P35443 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THBS4P35443 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THBS4P35443 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
THBS4P35443 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THBS4P35443 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THBS4P35443 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THBS4P35443 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THBS4P35443 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THBS4P35443 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THBS4P35443 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
THBS4P35443 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
THBS4P35443 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THBS4P35443 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THBS4P35443 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
THBS4P35443 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THBS4P35443 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THBS4P35443 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
THBS4P35443 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THBS4P35443 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THBS4P35443 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THBS4P35443 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THBS4P35443 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THBS4P35443 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
THBS4P35443 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THBS4P35443 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THBS4P35443 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THBS4P35443 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THBS4P35443 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THBS4P35443 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THBS4P35443 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms