Protein–RNA interactions for Protein: P33947

KDELR2, ER lumen protein-retaining receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR2P33947 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDELR2P33947 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDELR2P33947 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDELR2P33947 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDELR2P33947 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KDELR2P33947 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDELR2P33947 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDELR2P33947 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDELR2P33947 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDELR2P33947 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDELR2P33947 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDELR2P33947 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDELR2P33947 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDELR2P33947 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDELR2P33947 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDELR2P33947 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms