Protein–RNA interactions for Protein: P33947

KDELR2, ER lumen protein-retaining receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR2P33947 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDELR2P33947 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDELR2P33947 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDELR2P33947 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDELR2P33947 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDELR2P33947 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDELR2P33947 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KDELR2P33947 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDELR2P33947 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDELR2P33947 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDELR2P33947 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDELR2P33947 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDELR2P33947 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDELR2P33947 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDELR2P33947 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDELR2P33947 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDELR2P33947 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDELR2P33947 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms