Protein–RNA interactions for Protein: P33076

CIITA, MHC class II transactivator, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIITAP33076 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CIITAP33076 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CIITAP33076 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CIITAP33076 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CIITAP33076 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CIITAP33076 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CIITAP33076 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CIITAP33076 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CIITAP33076 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CIITAP33076 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CIITAP33076 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CIITAP33076 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CIITAP33076 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CIITAP33076 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CIITAP33076 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CIITAP33076 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CIITAP33076 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CIITAP33076 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CIITAP33076 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CIITAP33076 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CIITAP33076 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CIITAP33076 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CIITAP33076 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CIITAP33076 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CIITAP33076 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CIITAP33076 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CIITAP33076 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CIITAP33076 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CIITAP33076 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CIITAP33076 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CIITAP33076 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CIITAP33076 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CIITAP33076 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CIITAP33076 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CIITAP33076 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CIITAP33076 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CIITAP33076 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CIITAP33076 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CIITAP33076 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CIITAP33076 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CIITAP33076 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CIITAP33076 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CIITAP33076 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CIITAP33076 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CIITAP33076 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CIITAP33076 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CIITAP33076 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CIITAP33076 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CIITAP33076 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CIITAP33076 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CIITAP33076 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CIITAP33076 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CIITAP33076 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CIITAP33076 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CIITAP33076 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CIITAP33076 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CIITAP33076 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CIITAP33076 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CIITAP33076 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CIITAP33076 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CIITAP33076 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CIITAP33076 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CIITAP33076 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CIITAP33076 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CIITAP33076 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CIITAP33076 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CIITAP33076 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CIITAP33076 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CIITAP33076 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CIITAP33076 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CIITAP33076 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CIITAP33076 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CIITAP33076 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CIITAP33076 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CIITAP33076 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CIITAP33076 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CIITAP33076 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CIITAP33076 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CIITAP33076 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CIITAP33076 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CIITAP33076 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CIITAP33076 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CIITAP33076 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CIITAP33076 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CIITAP33076 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CIITAP33076 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CIITAP33076 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CIITAP33076 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CIITAP33076 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CIITAP33076 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CIITAP33076 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CIITAP33076 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CIITAP33076 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CIITAP33076 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CIITAP33076 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CIITAP33076 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CIITAP33076 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CIITAP33076 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CIITAP33076 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CIITAP33076 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms