Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TM4SF1P30408 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
TM4SF1P30408 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
TM4SF1P30408 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TM4SF1P30408 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TM4SF1P30408 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TM4SF1P30408 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TM4SF1P30408 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TM4SF1P30408 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TM4SF1P30408 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TM4SF1P30408 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TM4SF1P30408 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TM4SF1P30408 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TM4SF1P30408 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TM4SF1P30408 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TM4SF1P30408 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TM4SF1P30408 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TM4SF1P30408 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TM4SF1P30408 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TM4SF1P30408 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TM4SF1P30408 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TM4SF1P30408 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
TM4SF1P30408 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TM4SF1P30408 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TM4SF1P30408 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TM4SF1P30408 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TM4SF1P30408 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TM4SF1P30408 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TM4SF1P30408 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TM4SF1P30408 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TM4SF1P30408 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TM4SF1P30408 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TM4SF1P30408 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TM4SF1P30408 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TM4SF1P30408 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TM4SF1P30408 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TM4SF1P30408 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TM4SF1P30408 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TM4SF1P30408 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
TM4SF1P30408 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TM4SF1P30408 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TM4SF1P30408 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TM4SF1P30408 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TM4SF1P30408 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TM4SF1P30408 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TM4SF1P30408 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TM4SF1P30408 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TM4SF1P30408 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TM4SF1P30408 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TM4SF1P30408 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TM4SF1P30408 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TM4SF1P30408 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TM4SF1P30408 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TM4SF1P30408 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TM4SF1P30408 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TM4SF1P30408 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TM4SF1P30408 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TM4SF1P30408 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
TM4SF1P30408 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TM4SF1P30408 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TM4SF1P30408 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TM4SF1P30408 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TM4SF1P30408 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TM4SF1P30408 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TM4SF1P30408 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TM4SF1P30408 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TM4SF1P30408 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TM4SF1P30408 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TM4SF1P30408 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TM4SF1P30408 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
TM4SF1P30408 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TM4SF1P30408 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TM4SF1P30408 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TM4SF1P30408 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
TM4SF1P30408 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TM4SF1P30408 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TM4SF1P30408 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TM4SF1P30408 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TM4SF1P30408 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TM4SF1P30408 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TM4SF1P30408 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TM4SF1P30408 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TM4SF1P30408 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TM4SF1P30408 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TM4SF1P30408 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TM4SF1P30408 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TM4SF1P30408 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TM4SF1P30408 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TM4SF1P30408 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TM4SF1P30408 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TM4SF1P30408 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TM4SF1P30408 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TM4SF1P30408 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TM4SF1P30408 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
TM4SF1P30408 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TM4SF1P30408 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TM4SF1P30408 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TM4SF1P30408 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TM4SF1P30408 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TM4SF1P30408 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms