Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ECHS1P30084 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ECHS1P30084 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ECHS1P30084 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ECHS1P30084 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ECHS1P30084 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ECHS1P30084 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ECHS1P30084 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ECHS1P30084 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ECHS1P30084 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ECHS1P30084 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ECHS1P30084 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ECHS1P30084 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ECHS1P30084 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ECHS1P30084 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ECHS1P30084 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ECHS1P30084 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ECHS1P30084 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ECHS1P30084 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ECHS1P30084 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ECHS1P30084 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ECHS1P30084 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ECHS1P30084 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ECHS1P30084 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ECHS1P30084 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ECHS1P30084 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ECHS1P30084 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ECHS1P30084 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ECHS1P30084 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ECHS1P30084 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ECHS1P30084 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ECHS1P30084 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ECHS1P30084 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ECHS1P30084 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ECHS1P30084 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ECHS1P30084 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ECHS1P30084 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ECHS1P30084 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ECHS1P30084 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ECHS1P30084 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ECHS1P30084 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ECHS1P30084 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ECHS1P30084 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ECHS1P30084 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ECHS1P30084 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ECHS1P30084 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ECHS1P30084 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ECHS1P30084 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ECHS1P30084 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ECHS1P30084 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ECHS1P30084 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ECHS1P30084 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ECHS1P30084 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ECHS1P30084 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ECHS1P30084 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ECHS1P30084 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ECHS1P30084 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
ECHS1P30084 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ECHS1P30084 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ECHS1P30084 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ECHS1P30084 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECHS1P30084 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECHS1P30084 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ECHS1P30084 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ECHS1P30084 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ECHS1P30084 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ECHS1P30084 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ECHS1P30084 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ECHS1P30084 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ECHS1P30084 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ECHS1P30084 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ECHS1P30084 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ECHS1P30084 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ECHS1P30084 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ECHS1P30084 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ECHS1P30084 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ECHS1P30084 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ECHS1P30084 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ECHS1P30084 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ECHS1P30084 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ECHS1P30084 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ECHS1P30084 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ECHS1P30084 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ECHS1P30084 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ECHS1P30084 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ECHS1P30084 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ECHS1P30084 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ECHS1P30084 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ECHS1P30084 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ECHS1P30084 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ECHS1P30084 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ECHS1P30084 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ECHS1P30084 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ECHS1P30084 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ECHS1P30084 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ECHS1P30084 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ECHS1P30084 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ECHS1P30084 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ECHS1P30084 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ECHS1P30084 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms