Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CNGA1P29973 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CNGA1P29973 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CNGA1P29973 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNGA1P29973 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNGA1P29973 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNGA1P29973 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNGA1P29973 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNGA1P29973 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNGA1P29973 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CNGA1P29973 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CNGA1P29973 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNGA1P29973 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNGA1P29973 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNGA1P29973 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNGA1P29973 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNGA1P29973 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNGA1P29973 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNGA1P29973 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CNGA1P29973 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNGA1P29973 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNGA1P29973 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CNGA1P29973 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNGA1P29973 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNGA1P29973 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNGA1P29973 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNGA1P29973 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNGA1P29973 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CNGA1P29973 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CNGA1P29973 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CNGA1P29973 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNGA1P29973 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNGA1P29973 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNGA1P29973 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNGA1P29973 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CNGA1P29973 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNGA1P29973 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CNGA1P29973 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNGA1P29973 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNGA1P29973 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNGA1P29973 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CNGA1P29973 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CNGA1P29973 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNGA1P29973 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNGA1P29973 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNGA1P29973 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNGA1P29973 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNGA1P29973 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNGA1P29973 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNGA1P29973 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNGA1P29973 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNGA1P29973 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNGA1P29973 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CNGA1P29973 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNGA1P29973 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNGA1P29973 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNGA1P29973 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNGA1P29973 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNGA1P29973 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNGA1P29973 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNGA1P29973 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNGA1P29973 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CNGA1P29973 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNGA1P29973 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CNGA1P29973 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CNGA1P29973 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CNGA1P29973 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CNGA1P29973 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNGA1P29973 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNGA1P29973 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNGA1P29973 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CNGA1P29973 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNGA1P29973 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNGA1P29973 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNGA1P29973 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNGA1P29973 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNGA1P29973 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNGA1P29973 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNGA1P29973 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNGA1P29973 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CNGA1P29973 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNGA1P29973 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNGA1P29973 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNGA1P29973 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNGA1P29973 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CNGA1P29973 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNGA1P29973 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNGA1P29973 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNGA1P29973 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNGA1P29973 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNGA1P29973 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNGA1P29973 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNGA1P29973 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNGA1P29973 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNGA1P29973 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNGA1P29973 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CNGA1P29973 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNGA1P29973 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CNGA1P29973 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CNGA1P29973 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms