Protein–RNA interactions for Protein: P28222

HTR1B, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1BP28222 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTR1BP28222 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTR1BP28222 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTR1BP28222 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HTR1BP28222 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HTR1BP28222 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HTR1BP28222 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HTR1BP28222 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HTR1BP28222 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HTR1BP28222 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HTR1BP28222 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HTR1BP28222 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HTR1BP28222 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HTR1BP28222 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HTR1BP28222 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HTR1BP28222 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HTR1BP28222 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HTR1BP28222 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HTR1BP28222 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HTR1BP28222 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HTR1BP28222 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HTR1BP28222 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HTR1BP28222 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTR1BP28222 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTR1BP28222 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTR1BP28222 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTR1BP28222 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HTR1BP28222 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HTR1BP28222 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTR1BP28222 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTR1BP28222 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTR1BP28222 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTR1BP28222 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTR1BP28222 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTR1BP28222 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTR1BP28222 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTR1BP28222 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTR1BP28222 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTR1BP28222 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTR1BP28222 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTR1BP28222 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTR1BP28222 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTR1BP28222 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HTR1BP28222 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTR1BP28222 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTR1BP28222 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTR1BP28222 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTR1BP28222 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTR1BP28222 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTR1BP28222 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTR1BP28222 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTR1BP28222 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTR1BP28222 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTR1BP28222 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HTR1BP28222 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HTR1BP28222 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HTR1BP28222 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HTR1BP28222 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HTR1BP28222 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HTR1BP28222 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HTR1BP28222 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HTR1BP28222 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HTR1BP28222 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HTR1BP28222 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HTR1BP28222 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HTR1BP28222 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HTR1BP28222 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HTR1BP28222 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HTR1BP28222 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HTR1BP28222 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTR1BP28222 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTR1BP28222 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTR1BP28222 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTR1BP28222 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTR1BP28222 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTR1BP28222 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTR1BP28222 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HTR1BP28222 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTR1BP28222 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTR1BP28222 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HTR1BP28222 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTR1BP28222 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTR1BP28222 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTR1BP28222 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HTR1BP28222 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HTR1BP28222 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HTR1BP28222 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HTR1BP28222 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HTR1BP28222 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTR1BP28222 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTR1BP28222 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTR1BP28222 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HTR1BP28222 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HTR1BP28222 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HTR1BP28222 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HTR1BP28222 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HTR1BP28222 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTR1BP28222 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HTR1BP28222 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HTR1BP28222 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms