Protein–RNA interactions for Protein: P27824

CANX, Calnexin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CANXP27824 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CANXP27824 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CANXP27824 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CANXP27824 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CANXP27824 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CANXP27824 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CANXP27824 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CANXP27824 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CANXP27824 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CANXP27824 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CANXP27824 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CANXP27824 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CANXP27824 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CANXP27824 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CANXP27824 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CANXP27824 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CANXP27824 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
CANXP27824 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CANXP27824 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CANXP27824 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CANXP27824 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CANXP27824 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CANXP27824 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CANXP27824 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CANXP27824 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CANXP27824 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CANXP27824 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CANXP27824 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CANXP27824 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CANXP27824 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CANXP27824 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CANXP27824 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CANXP27824 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CANXP27824 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CANXP27824 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CANXP27824 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CANXP27824 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CANXP27824 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CANXP27824 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CANXP27824 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CANXP27824 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CANXP27824 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CANXP27824 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CANXP27824 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CANXP27824 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CANXP27824 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CANXP27824 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CANXP27824 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CANXP27824 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CANXP27824 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CANXP27824 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CANXP27824 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CANXP27824 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CANXP27824 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CANXP27824 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
CANXP27824 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CANXP27824 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
CANXP27824 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CANXP27824 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CANXP27824 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
CANXP27824 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CANXP27824 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CANXP27824 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CANXP27824 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CANXP27824 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CANXP27824 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CANXP27824 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CANXP27824 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CANXP27824 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CANXP27824 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CANXP27824 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CANXP27824 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CANXP27824 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CANXP27824 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CANXP27824 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CANXP27824 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CANXP27824 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CANXP27824 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CANXP27824 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CANXP27824 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CANXP27824 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CANXP27824 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CANXP27824 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CANXP27824 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CANXP27824 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CANXP27824 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
CANXP27824 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CANXP27824 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CANXP27824 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CANXP27824 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CANXP27824 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
CANXP27824 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CANXP27824 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CANXP27824 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CANXP27824 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
CANXP27824 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CANXP27824 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CANXP27824 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CANXP27824 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CANXP27824 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms