Protein–RNA interactions for Protein: P23677

ITPKA, Inositol-trisphosphate 3-kinase A, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITPKAP23677 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITPKAP23677 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITPKAP23677 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITPKAP23677 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITPKAP23677 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ITPKAP23677 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITPKAP23677 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITPKAP23677 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITPKAP23677 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITPKAP23677 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITPKAP23677 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITPKAP23677 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ITPKAP23677 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITPKAP23677 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITPKAP23677 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITPKAP23677 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ITPKAP23677 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITPKAP23677 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ITPKAP23677 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITPKAP23677 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITPKAP23677 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITPKAP23677 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITPKAP23677 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITPKAP23677 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ITPKAP23677 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITPKAP23677 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITPKAP23677 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITPKAP23677 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITPKAP23677 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITPKAP23677 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITPKAP23677 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITPKAP23677 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITPKAP23677 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITPKAP23677 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITPKAP23677 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITPKAP23677 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITPKAP23677 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITPKAP23677 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITPKAP23677 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITPKAP23677 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITPKAP23677 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITPKAP23677 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITPKAP23677 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITPKAP23677 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ITPKAP23677 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITPKAP23677 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITPKAP23677 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITPKAP23677 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITPKAP23677 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITPKAP23677 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITPKAP23677 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITPKAP23677 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITPKAP23677 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITPKAP23677 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ITPKAP23677 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITPKAP23677 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITPKAP23677 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ITPKAP23677 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITPKAP23677 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ITPKAP23677 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITPKAP23677 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITPKAP23677 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITPKAP23677 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITPKAP23677 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ITPKAP23677 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ITPKAP23677 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITPKAP23677 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITPKAP23677 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITPKAP23677 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITPKAP23677 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITPKAP23677 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITPKAP23677 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITPKAP23677 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITPKAP23677 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITPKAP23677 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITPKAP23677 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITPKAP23677 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITPKAP23677 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ITPKAP23677 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITPKAP23677 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITPKAP23677 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ITPKAP23677 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITPKAP23677 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITPKAP23677 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITPKAP23677 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITPKAP23677 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITPKAP23677 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITPKAP23677 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITPKAP23677 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ITPKAP23677 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ITPKAP23677 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITPKAP23677 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITPKAP23677 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ITPKAP23677 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITPKAP23677 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITPKAP23677 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITPKAP23677 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITPKAP23677 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITPKAP23677 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITPKAP23677 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms