Protein–RNA interactions for Protein: P23378

GLDC, Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLDCP23378 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GLDCP23378 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GLDCP23378 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GLDCP23378 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GLDCP23378 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GLDCP23378 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GLDCP23378 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GLDCP23378 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GLDCP23378 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GLDCP23378 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GLDCP23378 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GLDCP23378 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GLDCP23378 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GLDCP23378 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GLDCP23378 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GLDCP23378 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GLDCP23378 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GLDCP23378 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GLDCP23378 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GLDCP23378 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GLDCP23378 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GLDCP23378 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GLDCP23378 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GLDCP23378 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GLDCP23378 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GLDCP23378 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GLDCP23378 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GLDCP23378 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GLDCP23378 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLDCP23378 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLDCP23378 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GLDCP23378 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLDCP23378 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLDCP23378 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLDCP23378 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLDCP23378 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GLDCP23378 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GLDCP23378 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GLDCP23378 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GLDCP23378 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLDCP23378 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLDCP23378 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLDCP23378 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GLDCP23378 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GLDCP23378 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GLDCP23378 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GLDCP23378 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GLDCP23378 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GLDCP23378 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GLDCP23378 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GLDCP23378 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GLDCP23378 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GLDCP23378 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GLDCP23378 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GLDCP23378 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GLDCP23378 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GLDCP23378 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GLDCP23378 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GLDCP23378 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GLDCP23378 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GLDCP23378 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GLDCP23378 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GLDCP23378 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GLDCP23378 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GLDCP23378 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GLDCP23378 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GLDCP23378 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GLDCP23378 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GLDCP23378 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GLDCP23378 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GLDCP23378 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GLDCP23378 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GLDCP23378 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GLDCP23378 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GLDCP23378 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GLDCP23378 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GLDCP23378 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GLDCP23378 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GLDCP23378 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GLDCP23378 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GLDCP23378 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GLDCP23378 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GLDCP23378 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GLDCP23378 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GLDCP23378 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GLDCP23378 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GLDCP23378 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GLDCP23378 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GLDCP23378 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GLDCP23378 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GLDCP23378 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GLDCP23378 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GLDCP23378 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GLDCP23378 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GLDCP23378 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GLDCP23378 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GLDCP23378 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GLDCP23378 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GLDCP23378 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GLDCP23378 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms