Protein–RNA interactions for Protein: P20908

COL5A1, Collagen alpha-1(V) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1P20908 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL5A1P20908 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL5A1P20908 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
COL5A1P20908 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL5A1P20908 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL5A1P20908 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL5A1P20908 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL5A1P20908 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
COL5A1P20908 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL5A1P20908 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL5A1P20908 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL5A1P20908 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL5A1P20908 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL5A1P20908 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL5A1P20908 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL5A1P20908 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL5A1P20908 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL5A1P20908 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL5A1P20908 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL5A1P20908 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL5A1P20908 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL5A1P20908 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL5A1P20908 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
COL5A1P20908 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL5A1P20908 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL5A1P20908 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL5A1P20908 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL5A1P20908 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL5A1P20908 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL5A1P20908 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL5A1P20908 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL5A1P20908 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL5A1P20908 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL5A1P20908 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
COL5A1P20908 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL5A1P20908 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL5A1P20908 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL5A1P20908 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL5A1P20908 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
COL5A1P20908 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL5A1P20908 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL5A1P20908 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL5A1P20908 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL5A1P20908 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL5A1P20908 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COL5A1P20908 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL5A1P20908 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL5A1P20908 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL5A1P20908 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COL5A1P20908 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL5A1P20908 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL5A1P20908 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL5A1P20908 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL5A1P20908 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
COL5A1P20908 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL5A1P20908 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL5A1P20908 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL5A1P20908 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL5A1P20908 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL5A1P20908 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL5A1P20908 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL5A1P20908 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
COL5A1P20908 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL5A1P20908 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL5A1P20908 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL5A1P20908 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL5A1P20908 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL5A1P20908 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL5A1P20908 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
COL5A1P20908 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
COL5A1P20908 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL5A1P20908 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL5A1P20908 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL5A1P20908 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL5A1P20908 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL5A1P20908 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
COL5A1P20908 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL5A1P20908 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL5A1P20908 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL5A1P20908 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL5A1P20908 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL5A1P20908 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL5A1P20908 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
COL5A1P20908 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
COL5A1P20908 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL5A1P20908 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL5A1P20908 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL5A1P20908 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL5A1P20908 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL5A1P20908 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL5A1P20908 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL5A1P20908 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL5A1P20908 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL5A1P20908 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL5A1P20908 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL5A1P20908 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL5A1P20908 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL5A1P20908 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL5A1P20908 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL5A1P20908 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms