Protein–RNA interactions for Protein: P20138

CD33, Myeloid cell surface antigen CD33, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD33P20138 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD33P20138 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD33P20138 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD33P20138 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD33P20138 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD33P20138 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD33P20138 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD33P20138 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD33P20138 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CD33P20138 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD33P20138 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD33P20138 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD33P20138 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD33P20138 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD33P20138 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD33P20138 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CD33P20138 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CD33P20138 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CD33P20138 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CD33P20138 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD33P20138 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD33P20138 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD33P20138 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD33P20138 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD33P20138 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD33P20138 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD33P20138 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD33P20138 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD33P20138 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD33P20138 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD33P20138 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD33P20138 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD33P20138 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD33P20138 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD33P20138 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD33P20138 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD33P20138 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD33P20138 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD33P20138 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD33P20138 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD33P20138 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD33P20138 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD33P20138 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD33P20138 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD33P20138 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD33P20138 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD33P20138 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD33P20138 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD33P20138 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD33P20138 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD33P20138 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD33P20138 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD33P20138 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD33P20138 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD33P20138 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD33P20138 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD33P20138 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD33P20138 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD33P20138 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD33P20138 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD33P20138 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD33P20138 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD33P20138 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD33P20138 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD33P20138 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD33P20138 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD33P20138 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD33P20138 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD33P20138 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD33P20138 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD33P20138 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD33P20138 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD33P20138 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD33P20138 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD33P20138 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD33P20138 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD33P20138 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD33P20138 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD33P20138 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD33P20138 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD33P20138 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD33P20138 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD33P20138 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD33P20138 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD33P20138 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD33P20138 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD33P20138 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD33P20138 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD33P20138 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD33P20138 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD33P20138 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD33P20138 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CD33P20138 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD33P20138 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD33P20138 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD33P20138 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD33P20138 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD33P20138 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD33P20138 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD33P20138 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms