Protein–RNA interactions for Protein: P18084

ITGB5, Integrin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5P18084 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGB5P18084 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGB5P18084 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGB5P18084 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGB5P18084 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGB5P18084 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGB5P18084 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGB5P18084 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGB5P18084 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGB5P18084 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGB5P18084 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGB5P18084 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGB5P18084 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGB5P18084 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGB5P18084 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGB5P18084 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGB5P18084 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGB5P18084 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGB5P18084 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGB5P18084 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGB5P18084 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGB5P18084 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGB5P18084 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGB5P18084 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGB5P18084 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGB5P18084 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGB5P18084 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGB5P18084 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGB5P18084 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGB5P18084 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGB5P18084 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGB5P18084 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGB5P18084 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGB5P18084 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGB5P18084 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGB5P18084 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGB5P18084 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGB5P18084 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITGB5P18084 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGB5P18084 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGB5P18084 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGB5P18084 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGB5P18084 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGB5P18084 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGB5P18084 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGB5P18084 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGB5P18084 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
ITGB5P18084 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITGB5P18084 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITGB5P18084 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITGB5P18084 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITGB5P18084 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITGB5P18084 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITGB5P18084 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITGB5P18084 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITGB5P18084 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ITGB5P18084 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGB5P18084 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGB5P18084 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITGB5P18084 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITGB5P18084 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITGB5P18084 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITGB5P18084 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITGB5P18084 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGB5P18084 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGB5P18084 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGB5P18084 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGB5P18084 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGB5P18084 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGB5P18084 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGB5P18084 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGB5P18084 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ITGB5P18084 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ITGB5P18084 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITGB5P18084 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITGB5P18084 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITGB5P18084 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITGB5P18084 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGB5P18084 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGB5P18084 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGB5P18084 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGB5P18084 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGB5P18084 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITGB5P18084 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITGB5P18084 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITGB5P18084 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITGB5P18084 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGB5P18084 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGB5P18084 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGB5P18084 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGB5P18084 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGB5P18084 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGB5P18084 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGB5P18084 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGB5P18084 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGB5P18084 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGB5P18084 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGB5P18084 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGB5P18084 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGB5P18084 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.4 ms