Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CKMT2P17540 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CKMT2P17540 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CKMT2P17540 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CKMT2P17540 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CKMT2P17540 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CKMT2P17540 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CKMT2P17540 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CKMT2P17540 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CKMT2P17540 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CKMT2P17540 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CKMT2P17540 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CKMT2P17540 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CKMT2P17540 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CKMT2P17540 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CKMT2P17540 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CKMT2P17540 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CKMT2P17540 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKMT2P17540 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKMT2P17540 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKMT2P17540 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKMT2P17540 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKMT2P17540 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CKMT2P17540 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CKMT2P17540 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CKMT2P17540 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CKMT2P17540 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CKMT2P17540 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CKMT2P17540 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CKMT2P17540 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CKMT2P17540 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CKMT2P17540 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CKMT2P17540 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CKMT2P17540 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CKMT2P17540 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CKMT2P17540 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CKMT2P17540 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CKMT2P17540 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CKMT2P17540 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CKMT2P17540 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CKMT2P17540 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CKMT2P17540 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CKMT2P17540 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CKMT2P17540 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CKMT2P17540 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CKMT2P17540 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CKMT2P17540 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CKMT2P17540 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CKMT2P17540 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CKMT2P17540 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CKMT2P17540 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CKMT2P17540 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CKMT2P17540 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CKMT2P17540 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CKMT2P17540 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CKMT2P17540 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CKMT2P17540 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CKMT2P17540 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CKMT2P17540 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CKMT2P17540 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CKMT2P17540 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CKMT2P17540 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CKMT2P17540 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CKMT2P17540 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CKMT2P17540 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CKMT2P17540 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CKMT2P17540 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CKMT2P17540 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CKMT2P17540 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CKMT2P17540 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CKMT2P17540 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CKMT2P17540 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CKMT2P17540 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CKMT2P17540 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CKMT2P17540 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CKMT2P17540 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CKMT2P17540 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CKMT2P17540 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CKMT2P17540 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CKMT2P17540 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CKMT2P17540 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CKMT2P17540 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CKMT2P17540 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CKMT2P17540 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CKMT2P17540 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CKMT2P17540 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CKMT2P17540 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CKMT2P17540 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CKMT2P17540 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CKMT2P17540 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CKMT2P17540 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CKMT2P17540 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CKMT2P17540 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CKMT2P17540 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CKMT2P17540 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CKMT2P17540 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CKMT2P17540 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CKMT2P17540 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CKMT2P17540 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CKMT2P17540 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms