Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXB8P17481 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXB8P17481 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXB8P17481 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXB8P17481 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXB8P17481 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXB8P17481 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXB8P17481 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXB8P17481 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXB8P17481 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXB8P17481 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXB8P17481 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXB8P17481 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
HOXB8P17481 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXB8P17481 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXB8P17481 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXB8P17481 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HOXB8P17481 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HOXB8P17481 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HOXB8P17481 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXB8P17481 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXB8P17481 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXB8P17481 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXB8P17481 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXB8P17481 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXB8P17481 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXB8P17481 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXB8P17481 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXB8P17481 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXB8P17481 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXB8P17481 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXB8P17481 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXB8P17481 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXB8P17481 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXB8P17481 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXB8P17481 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXB8P17481 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXB8P17481 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXB8P17481 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXB8P17481 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXB8P17481 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXB8P17481 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXB8P17481 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXB8P17481 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXB8P17481 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXB8P17481 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXB8P17481 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXB8P17481 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXB8P17481 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXB8P17481 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXB8P17481 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXB8P17481 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXB8P17481 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXB8P17481 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXB8P17481 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXB8P17481 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXB8P17481 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXB8P17481 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXB8P17481 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXB8P17481 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXB8P17481 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXB8P17481 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXB8P17481 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXB8P17481 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXB8P17481 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXB8P17481 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXB8P17481 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXB8P17481 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXB8P17481 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXB8P17481 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXB8P17481 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXB8P17481 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXB8P17481 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXB8P17481 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXB8P17481 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXB8P17481 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXB8P17481 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXB8P17481 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXB8P17481 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXB8P17481 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXB8P17481 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXB8P17481 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXB8P17481 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXB8P17481 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXB8P17481 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXB8P17481 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXB8P17481 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXB8P17481 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXB8P17481 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXB8P17481 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXB8P17481 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXB8P17481 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXB8P17481 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXB8P17481 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXB8P17481 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXB8P17481 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXB8P17481 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXB8P17481 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXB8P17481 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXB8P17481 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms