Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EPCAMP16422 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EPCAMP16422 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EPCAMP16422 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EPCAMP16422 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EPCAMP16422 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
EPCAMP16422 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EPCAMP16422 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EPCAMP16422 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EPCAMP16422 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EPCAMP16422 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EPCAMP16422 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
EPCAMP16422 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EPCAMP16422 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EPCAMP16422 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EPCAMP16422 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EPCAMP16422 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EPCAMP16422 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EPCAMP16422 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EPCAMP16422 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EPCAMP16422 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EPCAMP16422 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
EPCAMP16422 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EPCAMP16422 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EPCAMP16422 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EPCAMP16422 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EPCAMP16422 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EPCAMP16422 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EPCAMP16422 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EPCAMP16422 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EPCAMP16422 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EPCAMP16422 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EPCAMP16422 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EPCAMP16422 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EPCAMP16422 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EPCAMP16422 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EPCAMP16422 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EPCAMP16422 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EPCAMP16422 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EPCAMP16422 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EPCAMP16422 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
EPCAMP16422 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EPCAMP16422 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EPCAMP16422 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
EPCAMP16422 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
EPCAMP16422 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPCAMP16422 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPCAMP16422 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
EPCAMP16422 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPCAMP16422 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPCAMP16422 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPCAMP16422 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPCAMP16422 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EPCAMP16422 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EPCAMP16422 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EPCAMP16422 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EPCAMP16422 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EPCAMP16422 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EPCAMP16422 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EPCAMP16422 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
EPCAMP16422 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EPCAMP16422 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EPCAMP16422 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EPCAMP16422 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EPCAMP16422 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EPCAMP16422 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EPCAMP16422 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EPCAMP16422 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EPCAMP16422 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EPCAMP16422 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EPCAMP16422 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EPCAMP16422 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EPCAMP16422 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EPCAMP16422 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EPCAMP16422 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EPCAMP16422 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EPCAMP16422 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EPCAMP16422 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EPCAMP16422 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
EPCAMP16422 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EPCAMP16422 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EPCAMP16422 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EPCAMP16422 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EPCAMP16422 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
EPCAMP16422 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EPCAMP16422 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EPCAMP16422 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
EPCAMP16422 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EPCAMP16422 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPCAMP16422 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPCAMP16422 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPCAMP16422 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPCAMP16422 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
EPCAMP16422 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EPCAMP16422 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EPCAMP16422 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EPCAMP16422 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EPCAMP16422 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EPCAMP16422 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EPCAMP16422 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms