Protein–RNA interactions for Protein: P15918

RAG1, V(D)J recombination-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG1P15918 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAG1P15918 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAG1P15918 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAG1P15918 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAG1P15918 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAG1P15918 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAG1P15918 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAG1P15918 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAG1P15918 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAG1P15918 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAG1P15918 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAG1P15918 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAG1P15918 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAG1P15918 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAG1P15918 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAG1P15918 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAG1P15918 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAG1P15918 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAG1P15918 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAG1P15918 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAG1P15918 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAG1P15918 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAG1P15918 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAG1P15918 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RAG1P15918 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RAG1P15918 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RAG1P15918 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RAG1P15918 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RAG1P15918 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAG1P15918 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAG1P15918 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAG1P15918 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAG1P15918 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAG1P15918 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAG1P15918 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RAG1P15918 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAG1P15918 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAG1P15918 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RAG1P15918 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RAG1P15918 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAG1P15918 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAG1P15918 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAG1P15918 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RAG1P15918 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAG1P15918 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAG1P15918 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAG1P15918 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAG1P15918 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RAG1P15918 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAG1P15918 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAG1P15918 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RAG1P15918 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RAG1P15918 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAG1P15918 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAG1P15918 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAG1P15918 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAG1P15918 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAG1P15918 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAG1P15918 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAG1P15918 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAG1P15918 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAG1P15918 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAG1P15918 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAG1P15918 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAG1P15918 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAG1P15918 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAG1P15918 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAG1P15918 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAG1P15918 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAG1P15918 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAG1P15918 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAG1P15918 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAG1P15918 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAG1P15918 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAG1P15918 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAG1P15918 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAG1P15918 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAG1P15918 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAG1P15918 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAG1P15918 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAG1P15918 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RAG1P15918 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RAG1P15918 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RAG1P15918 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAG1P15918 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAG1P15918 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAG1P15918 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAG1P15918 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAG1P15918 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAG1P15918 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RAG1P15918 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAG1P15918 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAG1P15918 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RAG1P15918 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RAG1P15918 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAG1P15918 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAG1P15918 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RAG1P15918 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAG1P15918 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RAG1P15918 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.8 ms