Protein–RNA interactions for Protein: P12081

HARS, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARSP12081 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HARSP12081 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HARSP12081 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HARSP12081 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
HARSP12081 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HARSP12081 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HARSP12081 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HARSP12081 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HARSP12081 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HARSP12081 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HARSP12081 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HARSP12081 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HARSP12081 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HARSP12081 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HARSP12081 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HARSP12081 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HARSP12081 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
HARSP12081 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HARSP12081 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HARSP12081 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HARSP12081 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HARSP12081 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HARSP12081 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HARSP12081 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HARSP12081 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HARSP12081 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HARSP12081 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HARSP12081 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HARSP12081 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HARSP12081 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HARSP12081 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HARSP12081 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HARSP12081 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HARSP12081 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HARSP12081 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HARSP12081 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HARSP12081 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HARSP12081 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HARSP12081 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HARSP12081 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HARSP12081 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HARSP12081 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HARSP12081 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HARSP12081 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HARSP12081 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
HARSP12081 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HARSP12081 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HARSP12081 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
HARSP12081 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HARSP12081 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HARSP12081 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HARSP12081 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HARSP12081 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HARSP12081 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HARSP12081 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HARSP12081 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HARSP12081 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HARSP12081 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HARSP12081 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HARSP12081 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HARSP12081 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HARSP12081 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HARSP12081 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HARSP12081 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HARSP12081 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HARSP12081 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HARSP12081 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HARSP12081 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HARSP12081 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HARSP12081 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HARSP12081 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HARSP12081 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HARSP12081 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HARSP12081 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HARSP12081 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HARSP12081 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HARSP12081 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HARSP12081 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HARSP12081 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HARSP12081 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HARSP12081 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HARSP12081 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HARSP12081 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
HARSP12081 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HARSP12081 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HARSP12081 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HARSP12081 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HARSP12081 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HARSP12081 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HARSP12081 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HARSP12081 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HARSP12081 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HARSP12081 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HARSP12081 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HARSP12081 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HARSP12081 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HARSP12081 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HARSP12081 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HARSP12081 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HARSP12081 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms