Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
CHGAP10645 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
CHGAP10645 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CHGAP10645 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CHGAP10645 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CHGAP10645 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CHGAP10645 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CHGAP10645 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CHGAP10645 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CHGAP10645 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CHGAP10645 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CHGAP10645 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CHGAP10645 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CHGAP10645 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CHGAP10645 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CHGAP10645 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CHGAP10645 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
CHGAP10645 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.01■■■■□ 3.52
CHGAP10645 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CHGAP10645 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CHGAP10645 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
CHGAP10645 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CHGAP10645 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CHGAP10645 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CHGAP10645 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CHGAP10645 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CHGAP10645 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CHGAP10645 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CHGAP10645 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CHGAP10645 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CHGAP10645 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CHGAP10645 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CHGAP10645 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CHGAP10645 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
CHGAP10645 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CHGAP10645 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
CHGAP10645 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CHGAP10645 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CHGAP10645 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CHGAP10645 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CHGAP10645 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CHGAP10645 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CHGAP10645 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CHGAP10645 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CHGAP10645 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CHGAP10645 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CHGAP10645 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CHGAP10645 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
CHGAP10645 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CHGAP10645 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CHGAP10645 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CHGAP10645 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CHGAP10645 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CHGAP10645 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CHGAP10645 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CHGAP10645 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CHGAP10645 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CHGAP10645 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CHGAP10645 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
CHGAP10645 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
CHGAP10645 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CHGAP10645 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CHGAP10645 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CHGAP10645 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CHGAP10645 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CHGAP10645 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CHGAP10645 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CHGAP10645 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
CHGAP10645 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CHGAP10645 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CHGAP10645 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CHGAP10645 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CHGAP10645 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CHGAP10645 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CHGAP10645 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CHGAP10645 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CHGAP10645 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
CHGAP10645 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
CHGAP10645 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CHGAP10645 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CHGAP10645 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
CHGAP10645 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CHGAP10645 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CHGAP10645 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CHGAP10645 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CHGAP10645 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CHGAP10645 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
CHGAP10645 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CHGAP10645 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CHGAP10645 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CHGAP10645 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CHGAP10645 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CHGAP10645 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CHGAP10645 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CHGAP10645 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
CHGAP10645 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
CHGAP10645 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CHGAP10645 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CHGAP10645 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CHGAP10645 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms