Protein–RNA interactions for Protein: P0C8F1

PATE4, Prostate and testis expressed protein 4, humanhuman

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATE4P0C8F1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PATE4P0C8F1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PATE4P0C8F1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PATE4P0C8F1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATE4P0C8F1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATE4P0C8F1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATE4P0C8F1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATE4P0C8F1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATE4P0C8F1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATE4P0C8F1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATE4P0C8F1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATE4P0C8F1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATE4P0C8F1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATE4P0C8F1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATE4P0C8F1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATE4P0C8F1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATE4P0C8F1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATE4P0C8F1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATE4P0C8F1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATE4P0C8F1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATE4P0C8F1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATE4P0C8F1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PATE4P0C8F1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATE4P0C8F1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATE4P0C8F1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PATE4P0C8F1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATE4P0C8F1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATE4P0C8F1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATE4P0C8F1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATE4P0C8F1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PATE4P0C8F1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PATE4P0C8F1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PATE4P0C8F1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PATE4P0C8F1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PATE4P0C8F1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PATE4P0C8F1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PATE4P0C8F1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PATE4P0C8F1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PATE4P0C8F1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PATE4P0C8F1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PATE4P0C8F1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PATE4P0C8F1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PATE4P0C8F1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PATE4P0C8F1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PATE4P0C8F1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PATE4P0C8F1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PATE4P0C8F1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PATE4P0C8F1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PATE4P0C8F1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PATE4P0C8F1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PATE4P0C8F1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PATE4P0C8F1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PATE4P0C8F1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PATE4P0C8F1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PATE4P0C8F1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PATE4P0C8F1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PATE4P0C8F1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PATE4P0C8F1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PATE4P0C8F1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PATE4P0C8F1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PATE4P0C8F1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PATE4P0C8F1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PATE4P0C8F1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PATE4P0C8F1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PATE4P0C8F1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PATE4P0C8F1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PATE4P0C8F1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PATE4P0C8F1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PATE4P0C8F1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PATE4P0C8F1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PATE4P0C8F1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PATE4P0C8F1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PATE4P0C8F1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PATE4P0C8F1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PATE4P0C8F1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PATE4P0C8F1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PATE4P0C8F1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PATE4P0C8F1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PATE4P0C8F1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PATE4P0C8F1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PATE4P0C8F1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PATE4P0C8F1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PATE4P0C8F1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PATE4P0C8F1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PATE4P0C8F1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PATE4P0C8F1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATE4P0C8F1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATE4P0C8F1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATE4P0C8F1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATE4P0C8F1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATE4P0C8F1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PATE4P0C8F1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PATE4P0C8F1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PATE4P0C8F1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PATE4P0C8F1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PATE4P0C8F1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PATE4P0C8F1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PATE4P0C8F1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PATE4P0C8F1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PATE4P0C8F1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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