Protein–RNA interactions for Protein: P09919

CSF3, Granulocyte colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3P09919 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF3P09919 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF3P09919 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF3P09919 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF3P09919 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF3P09919 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF3P09919 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF3P09919 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF3P09919 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF3P09919 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF3P09919 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF3P09919 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF3P09919 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF3P09919 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF3P09919 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF3P09919 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF3P09919 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF3P09919 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF3P09919 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF3P09919 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSF3P09919 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSF3P09919 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSF3P09919 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSF3P09919 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSF3P09919 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSF3P09919 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSF3P09919 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSF3P09919 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF3P09919 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF3P09919 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF3P09919 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF3P09919 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF3P09919 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF3P09919 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF3P09919 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF3P09919 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF3P09919 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF3P09919 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSF3P09919 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CSF3P09919 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF3P09919 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF3P09919 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF3P09919 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF3P09919 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF3P09919 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF3P09919 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF3P09919 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF3P09919 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF3P09919 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF3P09919 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF3P09919 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF3P09919 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF3P09919 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF3P09919 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF3P09919 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF3P09919 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF3P09919 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF3P09919 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF3P09919 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF3P09919 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF3P09919 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF3P09919 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF3P09919 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF3P09919 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF3P09919 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF3P09919 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF3P09919 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF3P09919 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF3P09919 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF3P09919 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF3P09919 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF3P09919 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF3P09919 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF3P09919 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF3P09919 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF3P09919 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF3P09919 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF3P09919 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF3P09919 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF3P09919 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF3P09919 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF3P09919 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF3P09919 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF3P09919 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF3P09919 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF3P09919 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF3P09919 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF3P09919 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF3P09919 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF3P09919 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF3P09919 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CSF3P09919 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF3P09919 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF3P09919 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF3P09919 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF3P09919 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF3P09919 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF3P09919 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF3P09919 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF3P09919 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms