Protein–RNA interactions for Protein: P08651

NFIC, Nuclear factor 1 C-type, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFICP08651 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFICP08651 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFICP08651 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFICP08651 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NFICP08651 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NFICP08651 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NFICP08651 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NFICP08651 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NFICP08651 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NFICP08651 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NFICP08651 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NFICP08651 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NFICP08651 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NFICP08651 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NFICP08651 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NFICP08651 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NFICP08651 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NFICP08651 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NFICP08651 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NFICP08651 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NFICP08651 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NFICP08651 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NFICP08651 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NFICP08651 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NFICP08651 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NFICP08651 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NFICP08651 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NFICP08651 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NFICP08651 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFICP08651 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFICP08651 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFICP08651 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFICP08651 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFICP08651 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFICP08651 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFICP08651 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFICP08651 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFICP08651 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFICP08651 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFICP08651 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFICP08651 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFICP08651 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFICP08651 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFICP08651 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFICP08651 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFICP08651 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFICP08651 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFICP08651 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFICP08651 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFICP08651 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFICP08651 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFICP08651 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFICP08651 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFICP08651 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFICP08651 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFICP08651 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFICP08651 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFICP08651 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFICP08651 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFICP08651 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFICP08651 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFICP08651 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFICP08651 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFICP08651 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NFICP08651 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFICP08651 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFICP08651 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFICP08651 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFICP08651 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFICP08651 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFICP08651 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFICP08651 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFICP08651 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFICP08651 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFICP08651 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFICP08651 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFICP08651 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NFICP08651 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFICP08651 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFICP08651 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFICP08651 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NFICP08651 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFICP08651 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFICP08651 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFICP08651 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFICP08651 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFICP08651 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFICP08651 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFICP08651 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFICP08651 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFICP08651 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFICP08651 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFICP08651 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFICP08651 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFICP08651 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFICP08651 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFICP08651 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFICP08651 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFICP08651 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFICP08651 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms