Protein–RNA interactions for Protein: P07949

RET, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase receptor Ret, humanhuman

Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETP07949 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RETP07949 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RETP07949 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RETP07949 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RETP07949 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RETP07949 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RETP07949 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RETP07949 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RETP07949 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RETP07949 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RETP07949 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RETP07949 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RETP07949 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RETP07949 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RETP07949 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RETP07949 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RETP07949 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RETP07949 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RETP07949 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RETP07949 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RETP07949 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RETP07949 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RETP07949 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RETP07949 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RETP07949 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RETP07949 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RETP07949 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RETP07949 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RETP07949 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RETP07949 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RETP07949 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RETP07949 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RETP07949 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RETP07949 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RETP07949 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RETP07949 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RETP07949 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RETP07949 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RETP07949 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RETP07949 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RETP07949 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RETP07949 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RETP07949 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RETP07949 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RETP07949 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RETP07949 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RETP07949 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RETP07949 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RETP07949 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RETP07949 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RETP07949 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RETP07949 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RETP07949 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RETP07949 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RETP07949 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RETP07949 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RETP07949 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RETP07949 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RETP07949 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RETP07949 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RETP07949 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RETP07949 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RETP07949 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RETP07949 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RETP07949 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RETP07949 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RETP07949 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RETP07949 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RETP07949 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RETP07949 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RETP07949 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RETP07949 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RETP07949 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RETP07949 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RETP07949 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RETP07949 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RETP07949 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RETP07949 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RETP07949 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RETP07949 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RETP07949 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RETP07949 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RETP07949 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RETP07949 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RETP07949 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RETP07949 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RETP07949 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RETP07949 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RETP07949 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RETP07949 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RETP07949 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RETP07949 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RETP07949 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RETP07949 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RETP07949 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RETP07949 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RETP07949 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RETP07949 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RETP07949 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RETP07949 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms