Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CENPBP07199 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CENPBP07199 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CENPBP07199 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CENPBP07199 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CENPBP07199 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CENPBP07199 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CENPBP07199 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CENPBP07199 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CENPBP07199 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CENPBP07199 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CENPBP07199 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CENPBP07199 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CENPBP07199 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CENPBP07199 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CENPBP07199 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CENPBP07199 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CENPBP07199 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CENPBP07199 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CENPBP07199 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CENPBP07199 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CENPBP07199 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CENPBP07199 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CENPBP07199 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CENPBP07199 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CENPBP07199 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CENPBP07199 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CENPBP07199 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CENPBP07199 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CENPBP07199 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CENPBP07199 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CENPBP07199 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CENPBP07199 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CENPBP07199 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CENPBP07199 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CENPBP07199 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CENPBP07199 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CENPBP07199 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CENPBP07199 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CENPBP07199 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CENPBP07199 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CENPBP07199 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CENPBP07199 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CENPBP07199 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CENPBP07199 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CENPBP07199 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CENPBP07199 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CENPBP07199 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CENPBP07199 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CENPBP07199 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CENPBP07199 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CENPBP07199 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CENPBP07199 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CENPBP07199 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CENPBP07199 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CENPBP07199 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CENPBP07199 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CENPBP07199 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
CENPBP07199 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CENPBP07199 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CENPBP07199 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CENPBP07199 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CENPBP07199 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CENPBP07199 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CENPBP07199 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CENPBP07199 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CENPBP07199 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CENPBP07199 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CENPBP07199 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CENPBP07199 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CENPBP07199 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
CENPBP07199 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CENPBP07199 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CENPBP07199 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CENPBP07199 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CENPBP07199 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CENPBP07199 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CENPBP07199 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CENPBP07199 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
CENPBP07199 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CENPBP07199 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CENPBP07199 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CENPBP07199 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CENPBP07199 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CENPBP07199 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CENPBP07199 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CENPBP07199 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CENPBP07199 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CENPBP07199 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CENPBP07199 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
CENPBP07199 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CENPBP07199 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CENPBP07199 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CENPBP07199 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CENPBP07199 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CENPBP07199 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CENPBP07199 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CENPBP07199 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CENPBP07199 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CENPBP07199 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms