Protein–RNA interactions for Protein: P06858

LPL, Lipoprotein lipase, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPLP06858 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LPLP06858 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LPLP06858 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LPLP06858 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LPLP06858 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LPLP06858 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LPLP06858 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LPLP06858 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LPLP06858 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LPLP06858 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LPLP06858 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LPLP06858 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LPLP06858 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LPLP06858 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LPLP06858 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LPLP06858 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LPLP06858 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LPLP06858 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LPLP06858 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LPLP06858 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LPLP06858 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LPLP06858 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LPLP06858 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LPLP06858 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LPLP06858 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LPLP06858 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LPLP06858 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LPLP06858 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LPLP06858 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LPLP06858 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LPLP06858 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LPLP06858 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LPLP06858 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LPLP06858 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LPLP06858 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LPLP06858 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LPLP06858 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LPLP06858 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LPLP06858 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LPLP06858 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LPLP06858 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LPLP06858 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LPLP06858 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LPLP06858 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LPLP06858 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LPLP06858 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LPLP06858 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LPLP06858 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LPLP06858 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LPLP06858 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LPLP06858 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LPLP06858 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LPLP06858 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LPLP06858 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LPLP06858 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LPLP06858 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LPLP06858 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LPLP06858 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LPLP06858 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LPLP06858 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LPLP06858 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LPLP06858 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LPLP06858 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LPLP06858 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LPLP06858 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LPLP06858 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LPLP06858 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LPLP06858 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LPLP06858 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LPLP06858 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LPLP06858 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LPLP06858 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LPLP06858 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LPLP06858 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LPLP06858 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LPLP06858 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LPLP06858 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LPLP06858 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LPLP06858 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LPLP06858 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LPLP06858 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LPLP06858 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LPLP06858 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LPLP06858 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LPLP06858 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LPLP06858 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LPLP06858 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LPLP06858 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LPLP06858 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LPLP06858 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LPLP06858 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LPLP06858 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LPLP06858 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LPLP06858 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LPLP06858 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LPLP06858 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LPLP06858 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LPLP06858 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LPLP06858 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LPLP06858 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms