Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SERPIND1P05546 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SERPIND1P05546 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SERPIND1P05546 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SERPIND1P05546 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SERPIND1P05546 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SERPIND1P05546 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SERPIND1P05546 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SERPIND1P05546 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SERPIND1P05546 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SERPIND1P05546 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SERPIND1P05546 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SERPIND1P05546 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SERPIND1P05546 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SERPIND1P05546 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SERPIND1P05546 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SERPIND1P05546 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SERPIND1P05546 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SERPIND1P05546 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SERPIND1P05546 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SERPIND1P05546 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SERPIND1P05546 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SERPIND1P05546 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SERPIND1P05546 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SERPIND1P05546 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SERPIND1P05546 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERPIND1P05546 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SERPIND1P05546 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SERPIND1P05546 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SERPIND1P05546 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SERPIND1P05546 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SERPIND1P05546 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SERPIND1P05546 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SERPIND1P05546 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SERPIND1P05546 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SERPIND1P05546 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SERPIND1P05546 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SERPIND1P05546 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERPIND1P05546 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERPIND1P05546 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERPIND1P05546 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERPIND1P05546 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERPIND1P05546 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERPIND1P05546 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERPIND1P05546 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERPIND1P05546 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERPIND1P05546 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPIND1P05546 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPIND1P05546 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPIND1P05546 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPIND1P05546 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPIND1P05546 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPIND1P05546 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPIND1P05546 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPIND1P05546 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPIND1P05546 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPIND1P05546 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPIND1P05546 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPIND1P05546 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPIND1P05546 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SERPIND1P05546 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SERPIND1P05546 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SERPIND1P05546 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERPIND1P05546 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERPIND1P05546 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERPIND1P05546 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERPIND1P05546 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERPIND1P05546 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERPIND1P05546 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERPIND1P05546 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERPIND1P05546 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERPIND1P05546 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERPIND1P05546 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERPIND1P05546 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERPIND1P05546 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERPIND1P05546 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SERPIND1P05546 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERPIND1P05546 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SERPIND1P05546 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SERPIND1P05546 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SERPIND1P05546 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SERPIND1P05546 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SERPIND1P05546 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SERPIND1P05546 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERPIND1P05546 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SERPIND1P05546 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERPIND1P05546 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERPIND1P05546 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SERPIND1P05546 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SERPIND1P05546 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SERPIND1P05546 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SERPIND1P05546 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SERPIND1P05546 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SERPIND1P05546 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SERPIND1P05546 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SERPIND1P05546 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SERPIND1P05546 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SERPIND1P05546 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SERPIND1P05546 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SERPIND1P05546 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.2 ms