Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FGAP02671 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FGAP02671 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
FGAP02671 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FGAP02671 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
FGAP02671 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FGAP02671 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
FGAP02671 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
FGAP02671 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
FGAP02671 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FGAP02671 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
FGAP02671 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FGAP02671 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.41■■■□□ 2.46
FGAP02671 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.41■■■□□ 2.46
FGAP02671 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
FGAP02671 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
FGAP02671 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
FGAP02671 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
FGAP02671 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
FGAP02671 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FGAP02671 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FGAP02671 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
FGAP02671 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
FGAP02671 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
FGAP02671 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FGAP02671 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
FGAP02671 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
FGAP02671 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
FGAP02671 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FGAP02671 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
FGAP02671 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
FGAP02671 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
FGAP02671 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FGAP02671 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
FGAP02671 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
FGAP02671 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
FGAP02671 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
FGAP02671 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FGAP02671 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FGAP02671 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FGAP02671 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FGAP02671 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FGAP02671 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FGAP02671 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
FGAP02671 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FGAP02671 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
FGAP02671 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FGAP02671 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FGAP02671 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FGAP02671 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
FGAP02671 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
FGAP02671 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
FGAP02671 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
FGAP02671 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
FGAP02671 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FGAP02671 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FGAP02671 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
FGAP02671 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FGAP02671 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FGAP02671 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
FGAP02671 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
FGAP02671 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FGAP02671 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FGAP02671 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FGAP02671 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FGAP02671 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FGAP02671 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FGAP02671 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
FGAP02671 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
FGAP02671 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
FGAP02671 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
FGAP02671 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
FGAP02671 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
FGAP02671 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
FGAP02671 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FGAP02671 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FGAP02671 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
FGAP02671 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FGAP02671 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
FGAP02671 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
FGAP02671 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FGAP02671 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
FGAP02671 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
FGAP02671 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
FGAP02671 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
FGAP02671 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FGAP02671 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FGAP02671 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FGAP02671 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FGAP02671 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FGAP02671 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FGAP02671 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FGAP02671 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
FGAP02671 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FGAP02671 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FGAP02671 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FGAP02671 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
FGAP02671 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
FGAP02671 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
FGAP02671 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms