Protein–RNA interactions for Protein: P02585

TNNC2, Troponin C, skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC2P02585 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNNC2P02585 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNNC2P02585 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TNNC2P02585 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNNC2P02585 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNNC2P02585 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TNNC2P02585 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TNNC2P02585 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNNC2P02585 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TNNC2P02585 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TNNC2P02585 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TNNC2P02585 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TNNC2P02585 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNNC2P02585 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNC2P02585 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNC2P02585 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNC2P02585 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNC2P02585 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNC2P02585 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNC2P02585 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNC2P02585 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNC2P02585 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNC2P02585 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNC2P02585 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNNC2P02585 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNNC2P02585 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNNC2P02585 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNNC2P02585 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNNC2P02585 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNNC2P02585 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNNC2P02585 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TNNC2P02585 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TNNC2P02585 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNNC2P02585 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNNC2P02585 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNNC2P02585 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNNC2P02585 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNNC2P02585 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNNC2P02585 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNNC2P02585 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNNC2P02585 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNNC2P02585 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNNC2P02585 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNC2P02585 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNC2P02585 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNC2P02585 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNC2P02585 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNC2P02585 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNC2P02585 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNC2P02585 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNC2P02585 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNC2P02585 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNC2P02585 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNC2P02585 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TNNC2P02585 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNNC2P02585 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNNC2P02585 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNNC2P02585 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNNC2P02585 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TNNC2P02585 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNNC2P02585 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNNC2P02585 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNNC2P02585 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNNC2P02585 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TNNC2P02585 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNNC2P02585 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TNNC2P02585 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNNC2P02585 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNNC2P02585 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNC2P02585 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNC2P02585 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNC2P02585 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNC2P02585 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNC2P02585 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNC2P02585 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNNC2P02585 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TNNC2P02585 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNNC2P02585 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNNC2P02585 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNNC2P02585 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNC2P02585 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNC2P02585 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNNC2P02585 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNNC2P02585 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNNC2P02585 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNC2P02585 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNC2P02585 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNC2P02585 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNC2P02585 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNC2P02585 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNC2P02585 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNC2P02585 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNC2P02585 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNC2P02585 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNC2P02585 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNC2P02585 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNNC2P02585 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNNC2P02585 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNNC2P02585 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNNC2P02585 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms