Protein–RNA interactions for Protein: P01730

CD4, T-cell surface glycoprotein CD4, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD4P01730 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CD4P01730 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CD4P01730 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CD4P01730 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CD4P01730 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CD4P01730 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CD4P01730 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CD4P01730 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CD4P01730 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CD4P01730 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CD4P01730 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CD4P01730 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CD4P01730 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CD4P01730 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CD4P01730 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CD4P01730 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CD4P01730 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CD4P01730 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CD4P01730 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CD4P01730 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CD4P01730 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CD4P01730 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CD4P01730 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CD4P01730 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CD4P01730 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CD4P01730 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CD4P01730 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CD4P01730 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CD4P01730 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CD4P01730 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CD4P01730 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CD4P01730 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CD4P01730 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CD4P01730 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CD4P01730 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CD4P01730 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CD4P01730 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CD4P01730 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CD4P01730 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CD4P01730 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CD4P01730 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CD4P01730 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CD4P01730 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CD4P01730 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CD4P01730 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CD4P01730 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CD4P01730 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CD4P01730 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CD4P01730 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CD4P01730 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CD4P01730 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CD4P01730 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CD4P01730 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CD4P01730 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CD4P01730 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CD4P01730 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CD4P01730 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CD4P01730 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CD4P01730 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CD4P01730 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CD4P01730 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CD4P01730 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CD4P01730 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CD4P01730 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CD4P01730 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CD4P01730 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CD4P01730 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CD4P01730 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CD4P01730 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CD4P01730 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CD4P01730 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CD4P01730 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CD4P01730 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CD4P01730 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CD4P01730 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CD4P01730 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CD4P01730 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CD4P01730 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CD4P01730 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CD4P01730 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CD4P01730 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CD4P01730 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CD4P01730 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CD4P01730 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CD4P01730 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CD4P01730 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CD4P01730 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CD4P01730 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CD4P01730 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CD4P01730 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CD4P01730 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CD4P01730 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CD4P01730 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CD4P01730 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CD4P01730 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CD4P01730 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CD4P01730 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CD4P01730 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CD4P01730 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CD4P01730 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms