Protein–RNA interactions for Protein: P01563

IFNA2, Interferon alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA2P01563 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFNA2P01563 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFNA2P01563 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
IFNA2P01563 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFNA2P01563 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFNA2P01563 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFNA2P01563 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFNA2P01563 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFNA2P01563 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFNA2P01563 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
IFNA2P01563 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFNA2P01563 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFNA2P01563 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFNA2P01563 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFNA2P01563 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
IFNA2P01563 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFNA2P01563 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
IFNA2P01563 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFNA2P01563 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFNA2P01563 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFNA2P01563 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFNA2P01563 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
IFNA2P01563 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFNA2P01563 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFNA2P01563 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
IFNA2P01563 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFNA2P01563 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFNA2P01563 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNA2P01563 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNA2P01563 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNA2P01563 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNA2P01563 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNA2P01563 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNA2P01563 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNA2P01563 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNA2P01563 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNA2P01563 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNA2P01563 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNA2P01563 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNA2P01563 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNA2P01563 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNA2P01563 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNA2P01563 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNA2P01563 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNA2P01563 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNA2P01563 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNA2P01563 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNA2P01563 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNA2P01563 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNA2P01563 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNA2P01563 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNA2P01563 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNA2P01563 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNA2P01563 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNA2P01563 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNA2P01563 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNA2P01563 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFNA2P01563 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFNA2P01563 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFNA2P01563 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFNA2P01563 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFNA2P01563 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFNA2P01563 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFNA2P01563 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFNA2P01563 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFNA2P01563 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFNA2P01563 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFNA2P01563 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFNA2P01563 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNA2P01563 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNA2P01563 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNA2P01563 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNA2P01563 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNA2P01563 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNA2P01563 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNA2P01563 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNA2P01563 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNA2P01563 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNA2P01563 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNA2P01563 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNA2P01563 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNA2P01563 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNA2P01563 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNA2P01563 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNA2P01563 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNA2P01563 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNA2P01563 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNA2P01563 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNA2P01563 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNA2P01563 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNA2P01563 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNA2P01563 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNA2P01563 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNA2P01563 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNA2P01563 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNA2P01563 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNA2P01563 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNA2P01563 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNA2P01563 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNA2P01563 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms