Protein–RNA interactions for Protein: P01375

TNF, Tumor necrosis factor, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFP01375 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFP01375 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFP01375 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFP01375 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFP01375 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFP01375 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFP01375 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFP01375 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFP01375 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFP01375 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFP01375 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFP01375 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFP01375 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFP01375 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFP01375 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFP01375 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFP01375 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFP01375 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFP01375 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TNFP01375 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFP01375 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFP01375 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFP01375 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFP01375 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFP01375 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFP01375 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFP01375 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFP01375 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFP01375 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFP01375 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFP01375 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFP01375 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFP01375 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFP01375 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFP01375 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFP01375 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFP01375 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFP01375 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFP01375 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFP01375 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFP01375 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFP01375 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFP01375 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFP01375 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFP01375 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFP01375 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFP01375 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFP01375 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFP01375 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFP01375 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFP01375 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFP01375 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFP01375 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFP01375 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFP01375 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFP01375 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFP01375 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFP01375 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFP01375 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFP01375 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFP01375 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFP01375 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFP01375 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNFP01375 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNFP01375 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNFP01375 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFP01375 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFP01375 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFP01375 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFP01375 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFP01375 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFP01375 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFP01375 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFP01375 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFP01375 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFP01375 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFP01375 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFP01375 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFP01375 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFP01375 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFP01375 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFP01375 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFP01375 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFP01375 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFP01375 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFP01375 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFP01375 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFP01375 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFP01375 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFP01375 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFP01375 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFP01375 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFP01375 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFP01375 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFP01375 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFP01375 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFP01375 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFP01375 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFP01375 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFP01375 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms