Protein–RNA interactions for Protein: O96013

PAK4, Serine/threonine-protein kinase PAK 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK4O96013 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PAK4O96013 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PAK4O96013 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAK4O96013 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAK4O96013 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAK4O96013 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAK4O96013 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAK4O96013 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAK4O96013 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAK4O96013 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAK4O96013 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAK4O96013 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAK4O96013 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PAK4O96013 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAK4O96013 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAK4O96013 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAK4O96013 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAK4O96013 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PAK4O96013 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAK4O96013 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAK4O96013 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAK4O96013 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAK4O96013 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAK4O96013 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAK4O96013 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAK4O96013 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAK4O96013 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAK4O96013 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PAK4O96013 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAK4O96013 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAK4O96013 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAK4O96013 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAK4O96013 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAK4O96013 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAK4O96013 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAK4O96013 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAK4O96013 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAK4O96013 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAK4O96013 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAK4O96013 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PAK4O96013 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PAK4O96013 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAK4O96013 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAK4O96013 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAK4O96013 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAK4O96013 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAK4O96013 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAK4O96013 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAK4O96013 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAK4O96013 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAK4O96013 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PAK4O96013 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAK4O96013 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PAK4O96013 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAK4O96013 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAK4O96013 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAK4O96013 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAK4O96013 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PAK4O96013 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAK4O96013 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAK4O96013 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAK4O96013 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PAK4O96013 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAK4O96013 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PAK4O96013 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAK4O96013 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAK4O96013 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAK4O96013 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAK4O96013 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAK4O96013 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAK4O96013 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAK4O96013 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAK4O96013 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAK4O96013 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAK4O96013 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAK4O96013 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAK4O96013 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAK4O96013 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAK4O96013 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAK4O96013 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAK4O96013 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAK4O96013 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAK4O96013 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAK4O96013 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAK4O96013 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAK4O96013 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAK4O96013 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAK4O96013 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAK4O96013 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAK4O96013 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAK4O96013 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAK4O96013 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAK4O96013 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAK4O96013 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAK4O96013 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAK4O96013 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAK4O96013 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAK4O96013 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAK4O96013 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAK4O96013 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms