Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
DDX58O95786 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
DDX58O95786 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
DDX58O95786 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
DDX58O95786 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
DDX58O95786 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
DDX58O95786 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
DDX58O95786 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
DDX58O95786 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
DDX58O95786 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
DDX58O95786 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
DDX58O95786 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
DDX58O95786 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
DDX58O95786 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
DDX58O95786 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
DDX58O95786 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
DDX58O95786 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
DDX58O95786 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
DDX58O95786 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
DDX58O95786 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
DDX58O95786 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
DDX58O95786 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
DDX58O95786 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
DDX58O95786 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
DDX58O95786 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
DDX58O95786 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
DDX58O95786 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
DDX58O95786 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
DDX58O95786 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
DDX58O95786 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
DDX58O95786 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
DDX58O95786 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
DDX58O95786 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
DDX58O95786 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
DDX58O95786 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
DDX58O95786 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
DDX58O95786 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
DDX58O95786 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
DDX58O95786 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
DDX58O95786 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
DDX58O95786 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
DDX58O95786 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
DDX58O95786 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
DDX58O95786 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
DDX58O95786 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
DDX58O95786 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
DDX58O95786 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
DDX58O95786 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
DDX58O95786 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
DDX58O95786 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
DDX58O95786 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
DDX58O95786 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
DDX58O95786 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
DDX58O95786 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
DDX58O95786 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
DDX58O95786 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
DDX58O95786 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
DDX58O95786 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
DDX58O95786 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
DDX58O95786 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
DDX58O95786 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
DDX58O95786 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
DDX58O95786 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
DDX58O95786 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
DDX58O95786 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
DDX58O95786 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
DDX58O95786 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
DDX58O95786 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
DDX58O95786 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
DDX58O95786 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
DDX58O95786 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
DDX58O95786 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
DDX58O95786 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
DDX58O95786 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
DDX58O95786 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
DDX58O95786 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
DDX58O95786 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
DDX58O95786 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
DDX58O95786 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
DDX58O95786 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
DDX58O95786 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
DDX58O95786 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
DDX58O95786 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
DDX58O95786 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
DDX58O95786 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
DDX58O95786 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
DDX58O95786 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
DDX58O95786 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
DDX58O95786 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
DDX58O95786 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
DDX58O95786 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
DDX58O95786 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
DDX58O95786 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
DDX58O95786 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
DDX58O95786 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
DDX58O95786 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
DDX58O95786 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
DDX58O95786 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
DDX58O95786 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
DDX58O95786 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms