Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LCA5LO95447 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LCA5LO95447 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LCA5LO95447 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LCA5LO95447 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LCA5LO95447 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LCA5LO95447 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LCA5LO95447 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LCA5LO95447 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LCA5LO95447 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LCA5LO95447 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LCA5LO95447 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LCA5LO95447 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LCA5LO95447 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LCA5LO95447 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LCA5LO95447 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LCA5LO95447 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LCA5LO95447 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LCA5LO95447 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LCA5LO95447 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LCA5LO95447 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LCA5LO95447 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LCA5LO95447 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LCA5LO95447 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LCA5LO95447 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LCA5LO95447 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LCA5LO95447 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LCA5LO95447 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LCA5LO95447 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LCA5LO95447 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LCA5LO95447 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LCA5LO95447 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LCA5LO95447 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LCA5LO95447 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LCA5LO95447 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LCA5LO95447 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LCA5LO95447 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LCA5LO95447 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LCA5LO95447 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LCA5LO95447 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LCA5LO95447 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LCA5LO95447 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LCA5LO95447 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LCA5LO95447 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LCA5LO95447 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LCA5LO95447 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LCA5LO95447 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LCA5LO95447 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LCA5LO95447 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LCA5LO95447 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LCA5LO95447 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LCA5LO95447 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LCA5LO95447 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LCA5LO95447 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LCA5LO95447 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LCA5LO95447 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LCA5LO95447 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LCA5LO95447 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LCA5LO95447 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LCA5LO95447 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LCA5LO95447 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LCA5LO95447 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LCA5LO95447 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LCA5LO95447 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LCA5LO95447 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LCA5LO95447 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LCA5LO95447 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LCA5LO95447 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LCA5LO95447 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LCA5LO95447 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LCA5LO95447 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LCA5LO95447 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LCA5LO95447 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LCA5LO95447 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LCA5LO95447 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LCA5LO95447 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
LCA5LO95447 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LCA5LO95447 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LCA5LO95447 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
LCA5LO95447 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LCA5LO95447 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LCA5LO95447 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LCA5LO95447 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
LCA5LO95447 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LCA5LO95447 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LCA5LO95447 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LCA5LO95447 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LCA5LO95447 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LCA5LO95447 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LCA5LO95447 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LCA5LO95447 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LCA5LO95447 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LCA5LO95447 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LCA5LO95447 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LCA5LO95447 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LCA5LO95447 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LCA5LO95447 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LCA5LO95447 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LCA5LO95447 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LCA5LO95447 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms