Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN7O94888 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN7O94888 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN7O94888 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN7O94888 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBXN7O94888 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBXN7O94888 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBXN7O94888 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN7O94888 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN7O94888 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN7O94888 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN7O94888 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBXN7O94888 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBXN7O94888 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBXN7O94888 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBXN7O94888 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBXN7O94888 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBXN7O94888 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBXN7O94888 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBXN7O94888 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBXN7O94888 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBXN7O94888 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBXN7O94888 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBXN7O94888 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBXN7O94888 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBXN7O94888 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBXN7O94888 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
UBXN7O94888 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN7O94888 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBXN7O94888 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBXN7O94888 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBXN7O94888 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBXN7O94888 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBXN7O94888 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBXN7O94888 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN7O94888 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN7O94888 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN7O94888 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN7O94888 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN7O94888 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN7O94888 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN7O94888 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN7O94888 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN7O94888 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN7O94888 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBXN7O94888 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBXN7O94888 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBXN7O94888 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBXN7O94888 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBXN7O94888 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBXN7O94888 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBXN7O94888 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBXN7O94888 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBXN7O94888 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
UBXN7O94888 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBXN7O94888 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBXN7O94888 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBXN7O94888 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBXN7O94888 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN7O94888 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN7O94888 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN7O94888 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN7O94888 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN7O94888 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN7O94888 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN7O94888 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN7O94888 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN7O94888 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
UBXN7O94888 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
UBXN7O94888 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN7O94888 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN7O94888 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN7O94888 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN7O94888 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN7O94888 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN7O94888 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN7O94888 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN7O94888 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN7O94888 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN7O94888 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN7O94888 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN7O94888 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN7O94888 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN7O94888 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN7O94888 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBXN7O94888 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBXN7O94888 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBXN7O94888 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBXN7O94888 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBXN7O94888 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBXN7O94888 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
UBXN7O94888 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBXN7O94888 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBXN7O94888 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBXN7O94888 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBXN7O94888 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBXN7O94888 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBXN7O94888 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBXN7O94888 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBXN7O94888 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms