Protein–RNA interactions for Protein: O76094

SRP72, Signal recognition particle subunit SRP72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP72O76094 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRP72O76094 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SRP72O76094 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRP72O76094 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRP72O76094 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRP72O76094 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRP72O76094 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRP72O76094 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRP72O76094 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRP72O76094 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRP72O76094 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRP72O76094 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRP72O76094 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRP72O76094 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SRP72O76094 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRP72O76094 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRP72O76094 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRP72O76094 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRP72O76094 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRP72O76094 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRP72O76094 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRP72O76094 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRP72O76094 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRP72O76094 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRP72O76094 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRP72O76094 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRP72O76094 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRP72O76094 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRP72O76094 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SRP72O76094 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SRP72O76094 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRP72O76094 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRP72O76094 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRP72O76094 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRP72O76094 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRP72O76094 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRP72O76094 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRP72O76094 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRP72O76094 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRP72O76094 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRP72O76094 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRP72O76094 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRP72O76094 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRP72O76094 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRP72O76094 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRP72O76094 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRP72O76094 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SRP72O76094 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SRP72O76094 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SRP72O76094 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRP72O76094 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRP72O76094 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRP72O76094 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRP72O76094 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRP72O76094 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRP72O76094 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRP72O76094 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRP72O76094 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRP72O76094 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRP72O76094 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRP72O76094 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRP72O76094 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRP72O76094 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SRP72O76094 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRP72O76094 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRP72O76094 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRP72O76094 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRP72O76094 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SRP72O76094 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SRP72O76094 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SRP72O76094 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SRP72O76094 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SRP72O76094 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SRP72O76094 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SRP72O76094 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SRP72O76094 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SRP72O76094 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SRP72O76094 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRP72O76094 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRP72O76094 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRP72O76094 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRP72O76094 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRP72O76094 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRP72O76094 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRP72O76094 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRP72O76094 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRP72O76094 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRP72O76094 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRP72O76094 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRP72O76094 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRP72O76094 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRP72O76094 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SRP72O76094 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRP72O76094 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRP72O76094 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRP72O76094 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRP72O76094 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRP72O76094 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRP72O76094 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRP72O76094 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms