Protein–RNA interactions for Protein: O76050

NEURL1, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1O76050 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEURL1O76050 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEURL1O76050 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEURL1O76050 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEURL1O76050 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEURL1O76050 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEURL1O76050 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEURL1O76050 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEURL1O76050 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEURL1O76050 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NEURL1O76050 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEURL1O76050 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEURL1O76050 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEURL1O76050 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEURL1O76050 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEURL1O76050 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEURL1O76050 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEURL1O76050 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEURL1O76050 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEURL1O76050 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEURL1O76050 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEURL1O76050 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEURL1O76050 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEURL1O76050 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEURL1O76050 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEURL1O76050 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEURL1O76050 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NEURL1O76050 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEURL1O76050 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEURL1O76050 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEURL1O76050 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEURL1O76050 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NEURL1O76050 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEURL1O76050 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NEURL1O76050 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NEURL1O76050 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEURL1O76050 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEURL1O76050 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEURL1O76050 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEURL1O76050 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEURL1O76050 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NEURL1O76050 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEURL1O76050 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEURL1O76050 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NEURL1O76050 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEURL1O76050 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEURL1O76050 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEURL1O76050 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEURL1O76050 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEURL1O76050 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEURL1O76050 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEURL1O76050 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEURL1O76050 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEURL1O76050 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEURL1O76050 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NEURL1O76050 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEURL1O76050 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEURL1O76050 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEURL1O76050 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NEURL1O76050 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEURL1O76050 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEURL1O76050 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEURL1O76050 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEURL1O76050 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEURL1O76050 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEURL1O76050 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEURL1O76050 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEURL1O76050 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEURL1O76050 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEURL1O76050 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEURL1O76050 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEURL1O76050 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEURL1O76050 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEURL1O76050 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEURL1O76050 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEURL1O76050 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEURL1O76050 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NEURL1O76050 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEURL1O76050 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEURL1O76050 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEURL1O76050 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NEURL1O76050 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEURL1O76050 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEURL1O76050 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NEURL1O76050 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEURL1O76050 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEURL1O76050 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEURL1O76050 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEURL1O76050 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEURL1O76050 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEURL1O76050 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEURL1O76050 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEURL1O76050 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEURL1O76050 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEURL1O76050 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEURL1O76050 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEURL1O76050 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEURL1O76050 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEURL1O76050 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEURL1O76050 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms