Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIOO75962 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIOO75962 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIOO75962 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIOO75962 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIOO75962 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIOO75962 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIOO75962 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIOO75962 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIOO75962 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIOO75962 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIOO75962 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIOO75962 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIOO75962 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRIOO75962 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIOO75962 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIOO75962 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIOO75962 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIOO75962 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIOO75962 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIOO75962 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIOO75962 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIOO75962 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIOO75962 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIOO75962 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIOO75962 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIOO75962 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIOO75962 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIOO75962 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIOO75962 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIOO75962 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIOO75962 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIOO75962 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIOO75962 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIOO75962 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIOO75962 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIOO75962 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIOO75962 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIOO75962 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIOO75962 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIOO75962 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIOO75962 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIOO75962 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIOO75962 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIOO75962 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIOO75962 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIOO75962 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIOO75962 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIOO75962 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIOO75962 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIOO75962 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIOO75962 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIOO75962 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIOO75962 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIOO75962 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIOO75962 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIOO75962 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIOO75962 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIOO75962 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIOO75962 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIOO75962 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIOO75962 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIOO75962 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIOO75962 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIOO75962 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIOO75962 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIOO75962 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIOO75962 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIOO75962 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TRIOO75962 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
TRIOO75962 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIOO75962 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIOO75962 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIOO75962 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIOO75962 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIOO75962 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIOO75962 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIOO75962 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIOO75962 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIOO75962 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIOO75962 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIOO75962 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIOO75962 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIOO75962 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIOO75962 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIOO75962 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIOO75962 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIOO75962 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIOO75962 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIOO75962 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIOO75962 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.8
TRIOO75962 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIOO75962 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIOO75962 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIOO75962 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIOO75962 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIOO75962 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIOO75962 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIOO75962 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIOO75962 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms