Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCTN3O75935 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCTN3O75935 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCTN3O75935 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DCTN3O75935 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DCTN3O75935 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DCTN3O75935 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCTN3O75935 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCTN3O75935 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCTN3O75935 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCTN3O75935 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCTN3O75935 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCTN3O75935 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCTN3O75935 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCTN3O75935 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCTN3O75935 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DCTN3O75935 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCTN3O75935 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCTN3O75935 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DCTN3O75935 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCTN3O75935 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCTN3O75935 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCTN3O75935 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCTN3O75935 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCTN3O75935 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCTN3O75935 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCTN3O75935 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCTN3O75935 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCTN3O75935 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCTN3O75935 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCTN3O75935 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCTN3O75935 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCTN3O75935 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DCTN3O75935 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DCTN3O75935 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DCTN3O75935 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DCTN3O75935 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DCTN3O75935 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCTN3O75935 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCTN3O75935 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCTN3O75935 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCTN3O75935 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCTN3O75935 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCTN3O75935 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCTN3O75935 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCTN3O75935 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCTN3O75935 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCTN3O75935 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCTN3O75935 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCTN3O75935 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DCTN3O75935 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCTN3O75935 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCTN3O75935 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCTN3O75935 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCTN3O75935 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCTN3O75935 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCTN3O75935 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCTN3O75935 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCTN3O75935 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCTN3O75935 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DCTN3O75935 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCTN3O75935 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCTN3O75935 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DCTN3O75935 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DCTN3O75935 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DCTN3O75935 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DCTN3O75935 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DCTN3O75935 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DCTN3O75935 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DCTN3O75935 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCTN3O75935 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCTN3O75935 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCTN3O75935 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCTN3O75935 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCTN3O75935 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCTN3O75935 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCTN3O75935 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCTN3O75935 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCTN3O75935 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCTN3O75935 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DCTN3O75935 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCTN3O75935 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCTN3O75935 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCTN3O75935 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DCTN3O75935 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCTN3O75935 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DCTN3O75935 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DCTN3O75935 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCTN3O75935 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCTN3O75935 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCTN3O75935 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCTN3O75935 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCTN3O75935 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCTN3O75935 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCTN3O75935 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
DCTN3O75935 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCTN3O75935 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCTN3O75935 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCTN3O75935 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCTN3O75935 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.5 ms