Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNKO75909 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNKO75909 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNKO75909 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNKO75909 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNKO75909 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNKO75909 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNKO75909 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNKO75909 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNKO75909 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNKO75909 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNKO75909 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNKO75909 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNKO75909 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNKO75909 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNKO75909 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNKO75909 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNKO75909 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNKO75909 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNKO75909 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNKO75909 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNKO75909 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNKO75909 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNKO75909 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNKO75909 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNKO75909 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNKO75909 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNKO75909 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNKO75909 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNKO75909 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNKO75909 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNKO75909 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNKO75909 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNKO75909 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNKO75909 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNKO75909 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNKO75909 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNKO75909 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNKO75909 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNKO75909 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNKO75909 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNKO75909 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNKO75909 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNKO75909 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNKO75909 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCNKO75909 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCNKO75909 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNKO75909 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNKO75909 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNKO75909 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNKO75909 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNKO75909 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNKO75909 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNKO75909 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNKO75909 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNKO75909 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNKO75909 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNKO75909 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNKO75909 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNKO75909 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNKO75909 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNKO75909 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNKO75909 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNKO75909 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNKO75909 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNKO75909 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNKO75909 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNKO75909 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNKO75909 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNKO75909 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNKO75909 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNKO75909 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNKO75909 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNKO75909 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNKO75909 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNKO75909 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNKO75909 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNKO75909 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNKO75909 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNKO75909 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNKO75909 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNKO75909 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNKO75909 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNKO75909 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNKO75909 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNKO75909 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNKO75909 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNKO75909 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNKO75909 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNKO75909 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNKO75909 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNKO75909 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNKO75909 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNKO75909 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNKO75909 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNKO75909 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNKO75909 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNKO75909 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNKO75909 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNKO75909 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1549.3 ms