Protein–RNA interactions for Protein: O75879

GATB, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATBO75879 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GATBO75879 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GATBO75879 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GATBO75879 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GATBO75879 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GATBO75879 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATBO75879 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATBO75879 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATBO75879 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATBO75879 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATBO75879 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATBO75879 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATBO75879 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATBO75879 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATBO75879 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GATBO75879 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATBO75879 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GATBO75879 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GATBO75879 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATBO75879 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATBO75879 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATBO75879 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATBO75879 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATBO75879 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATBO75879 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATBO75879 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATBO75879 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATBO75879 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATBO75879 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATBO75879 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATBO75879 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATBO75879 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATBO75879 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATBO75879 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATBO75879 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATBO75879 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GATBO75879 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GATBO75879 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GATBO75879 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GATBO75879 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATBO75879 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATBO75879 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GATBO75879 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATBO75879 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATBO75879 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATBO75879 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATBO75879 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATBO75879 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATBO75879 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATBO75879 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATBO75879 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GATBO75879 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GATBO75879 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GATBO75879 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GATBO75879 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GATBO75879 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GATBO75879 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GATBO75879 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GATBO75879 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GATBO75879 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GATBO75879 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GATBO75879 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GATBO75879 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GATBO75879 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GATBO75879 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GATBO75879 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GATBO75879 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GATBO75879 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GATBO75879 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GATBO75879 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GATBO75879 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GATBO75879 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GATBO75879 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GATBO75879 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GATBO75879 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GATBO75879 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GATBO75879 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATBO75879 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATBO75879 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATBO75879 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATBO75879 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATBO75879 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATBO75879 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GATBO75879 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GATBO75879 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GATBO75879 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GATBO75879 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GATBO75879 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATBO75879 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATBO75879 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATBO75879 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATBO75879 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATBO75879 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATBO75879 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATBO75879 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GATBO75879 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATBO75879 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATBO75879 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATBO75879 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATBO75879 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms