Protein–RNA interactions for Protein: O75688

PPM1B, Protein phosphatase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1BO75688 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPM1BO75688 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPM1BO75688 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPM1BO75688 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PPM1BO75688 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPM1BO75688 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPM1BO75688 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPM1BO75688 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPM1BO75688 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPM1BO75688 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPM1BO75688 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPM1BO75688 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPM1BO75688 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPM1BO75688 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPM1BO75688 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPM1BO75688 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPM1BO75688 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPM1BO75688 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPM1BO75688 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPM1BO75688 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PPM1BO75688 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPM1BO75688 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPM1BO75688 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPM1BO75688 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPM1BO75688 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPM1BO75688 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPM1BO75688 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPM1BO75688 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPM1BO75688 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPM1BO75688 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPM1BO75688 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPM1BO75688 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPM1BO75688 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPM1BO75688 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPM1BO75688 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPM1BO75688 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PPM1BO75688 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PPM1BO75688 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PPM1BO75688 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPM1BO75688 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPM1BO75688 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPM1BO75688 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPM1BO75688 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPM1BO75688 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPM1BO75688 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPM1BO75688 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPM1BO75688 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPM1BO75688 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPM1BO75688 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPM1BO75688 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPM1BO75688 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPM1BO75688 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PPM1BO75688 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPM1BO75688 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPM1BO75688 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1BO75688 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1BO75688 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1BO75688 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1BO75688 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1BO75688 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1BO75688 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1BO75688 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1BO75688 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1BO75688 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1BO75688 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1BO75688 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1BO75688 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1BO75688 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1BO75688 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1BO75688 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1BO75688 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1BO75688 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1BO75688 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1BO75688 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1BO75688 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1BO75688 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1BO75688 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1BO75688 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1BO75688 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1BO75688 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1BO75688 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPM1BO75688 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPM1BO75688 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPM1BO75688 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPM1BO75688 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PPM1BO75688 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPM1BO75688 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPM1BO75688 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPM1BO75688 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPM1BO75688 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPM1BO75688 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPM1BO75688 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPM1BO75688 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPM1BO75688 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPM1BO75688 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPM1BO75688 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPM1BO75688 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PPM1BO75688 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPM1BO75688 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPM1BO75688 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms