Protein–RNA interactions for Protein: O75674

TOM1L1, TOM1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1L1O75674 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOM1L1O75674 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOM1L1O75674 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOM1L1O75674 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOM1L1O75674 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TOM1L1O75674 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
TOM1L1O75674 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOM1L1O75674 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOM1L1O75674 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOM1L1O75674 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOM1L1O75674 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOM1L1O75674 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOM1L1O75674 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOM1L1O75674 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOM1L1O75674 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOM1L1O75674 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOM1L1O75674 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOM1L1O75674 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOM1L1O75674 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOM1L1O75674 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOM1L1O75674 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOM1L1O75674 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TOM1L1O75674 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOM1L1O75674 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOM1L1O75674 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOM1L1O75674 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOM1L1O75674 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOM1L1O75674 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOM1L1O75674 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOM1L1O75674 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOM1L1O75674 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOM1L1O75674 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOM1L1O75674 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOM1L1O75674 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOM1L1O75674 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOM1L1O75674 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOM1L1O75674 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOM1L1O75674 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOM1L1O75674 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOM1L1O75674 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOM1L1O75674 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TOM1L1O75674 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TOM1L1O75674 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TOM1L1O75674 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TOM1L1O75674 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOM1L1O75674 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOM1L1O75674 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOM1L1O75674 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOM1L1O75674 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOM1L1O75674 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOM1L1O75674 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOM1L1O75674 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOM1L1O75674 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOM1L1O75674 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOM1L1O75674 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOM1L1O75674 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TOM1L1O75674 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOM1L1O75674 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOM1L1O75674 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOM1L1O75674 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TOM1L1O75674 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOM1L1O75674 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOM1L1O75674 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOM1L1O75674 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOM1L1O75674 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOM1L1O75674 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOM1L1O75674 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOM1L1O75674 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOM1L1O75674 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOM1L1O75674 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOM1L1O75674 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOM1L1O75674 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TOM1L1O75674 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TOM1L1O75674 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TOM1L1O75674 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TOM1L1O75674 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TOM1L1O75674 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOM1L1O75674 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOM1L1O75674 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOM1L1O75674 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOM1L1O75674 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TOM1L1O75674 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOM1L1O75674 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOM1L1O75674 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOM1L1O75674 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOM1L1O75674 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOM1L1O75674 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOM1L1O75674 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOM1L1O75674 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOM1L1O75674 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOM1L1O75674 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOM1L1O75674 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOM1L1O75674 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOM1L1O75674 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOM1L1O75674 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOM1L1O75674 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOM1L1O75674 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOM1L1O75674 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOM1L1O75674 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOM1L1O75674 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms