Protein–RNA interactions for Protein: O75387

SLC43A1, Large neutral amino acids transporter small subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A1O75387 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC43A1O75387 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC43A1O75387 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC43A1O75387 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC43A1O75387 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC43A1O75387 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC43A1O75387 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC43A1O75387 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC43A1O75387 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC43A1O75387 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC43A1O75387 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC43A1O75387 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC43A1O75387 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC43A1O75387 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC43A1O75387 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC43A1O75387 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC43A1O75387 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC43A1O75387 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC43A1O75387 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC43A1O75387 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC43A1O75387 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC43A1O75387 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC43A1O75387 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC43A1O75387 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC43A1O75387 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC43A1O75387 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC43A1O75387 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC43A1O75387 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC43A1O75387 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC43A1O75387 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC43A1O75387 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC43A1O75387 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC43A1O75387 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC43A1O75387 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC43A1O75387 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC43A1O75387 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC43A1O75387 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC43A1O75387 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC43A1O75387 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC43A1O75387 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC43A1O75387 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC43A1O75387 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC43A1O75387 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC43A1O75387 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC43A1O75387 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC43A1O75387 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC43A1O75387 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC43A1O75387 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC43A1O75387 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC43A1O75387 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC43A1O75387 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC43A1O75387 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC43A1O75387 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC43A1O75387 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC43A1O75387 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC43A1O75387 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC43A1O75387 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC43A1O75387 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC43A1O75387 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC43A1O75387 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC43A1O75387 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC43A1O75387 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC43A1O75387 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC43A1O75387 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC43A1O75387 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC43A1O75387 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC43A1O75387 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC43A1O75387 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC43A1O75387 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC43A1O75387 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC43A1O75387 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC43A1O75387 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC43A1O75387 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC43A1O75387 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC43A1O75387 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC43A1O75387 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC43A1O75387 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC43A1O75387 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC43A1O75387 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC43A1O75387 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC43A1O75387 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC43A1O75387 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC43A1O75387 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC43A1O75387 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC43A1O75387 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC43A1O75387 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC43A1O75387 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC43A1O75387 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC43A1O75387 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC43A1O75387 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC43A1O75387 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC43A1O75387 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC43A1O75387 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC43A1O75387 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC43A1O75387 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC43A1O75387 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC43A1O75387 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC43A1O75387 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC43A1O75387 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC43A1O75387 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms