Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PITX3O75364 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PITX3O75364 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITX3O75364 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITX3O75364 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITX3O75364 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITX3O75364 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITX3O75364 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITX3O75364 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITX3O75364 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITX3O75364 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PITX3O75364 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PITX3O75364 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PITX3O75364 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PITX3O75364 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PITX3O75364 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PITX3O75364 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PITX3O75364 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PITX3O75364 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PITX3O75364 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PITX3O75364 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PITX3O75364 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PITX3O75364 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PITX3O75364 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PITX3O75364 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PITX3O75364 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PITX3O75364 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PITX3O75364 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITX3O75364 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITX3O75364 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITX3O75364 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITX3O75364 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITX3O75364 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITX3O75364 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITX3O75364 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITX3O75364 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITX3O75364 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITX3O75364 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PITX3O75364 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITX3O75364 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITX3O75364 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITX3O75364 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITX3O75364 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITX3O75364 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITX3O75364 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITX3O75364 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITX3O75364 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITX3O75364 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITX3O75364 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITX3O75364 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PITX3O75364 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PITX3O75364 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PITX3O75364 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PITX3O75364 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PITX3O75364 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PITX3O75364 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PITX3O75364 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PITX3O75364 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PITX3O75364 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PITX3O75364 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PITX3O75364 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PITX3O75364 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITX3O75364 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITX3O75364 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITX3O75364 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITX3O75364 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITX3O75364 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITX3O75364 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITX3O75364 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITX3O75364 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITX3O75364 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITX3O75364 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITX3O75364 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITX3O75364 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITX3O75364 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX3O75364 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX3O75364 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX3O75364 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX3O75364 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PITX3O75364 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITX3O75364 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITX3O75364 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITX3O75364 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITX3O75364 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITX3O75364 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITX3O75364 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITX3O75364 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITX3O75364 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITX3O75364 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITX3O75364 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITX3O75364 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITX3O75364 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITX3O75364 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITX3O75364 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PITX3O75364 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITX3O75364 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PITX3O75364 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITX3O75364 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITX3O75364 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITX3O75364 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms