Protein–RNA interactions for Protein: O60673

REV3L, DNA polymerase zeta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 3,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REV3LO60673 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
REV3LO60673 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
REV3LO60673 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
REV3LO60673 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
REV3LO60673 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
REV3LO60673 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
REV3LO60673 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
REV3LO60673 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
REV3LO60673 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
REV3LO60673 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
REV3LO60673 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
REV3LO60673 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
REV3LO60673 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
REV3LO60673 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
REV3LO60673 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
REV3LO60673 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
REV3LO60673 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
REV3LO60673 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
REV3LO60673 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
REV3LO60673 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
REV3LO60673 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
REV3LO60673 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
REV3LO60673 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
REV3LO60673 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
REV3LO60673 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
REV3LO60673 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
REV3LO60673 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
REV3LO60673 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
REV3LO60673 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
REV3LO60673 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
REV3LO60673 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
REV3LO60673 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
REV3LO60673 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
REV3LO60673 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
REV3LO60673 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
REV3LO60673 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
REV3LO60673 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
REV3LO60673 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
REV3LO60673 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
REV3LO60673 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
REV3LO60673 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
REV3LO60673 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
REV3LO60673 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
REV3LO60673 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
REV3LO60673 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
REV3LO60673 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
REV3LO60673 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
REV3LO60673 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
REV3LO60673 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
REV3LO60673 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
REV3LO60673 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
REV3LO60673 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
REV3LO60673 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
REV3LO60673 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
REV3LO60673 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
REV3LO60673 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
REV3LO60673 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
REV3LO60673 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
REV3LO60673 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
REV3LO60673 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
REV3LO60673 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
REV3LO60673 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
REV3LO60673 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
REV3LO60673 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
REV3LO60673 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
REV3LO60673 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
REV3LO60673 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
REV3LO60673 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
REV3LO60673 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
REV3LO60673 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
REV3LO60673 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
REV3LO60673 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
REV3LO60673 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
REV3LO60673 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
REV3LO60673 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
REV3LO60673 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
REV3LO60673 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
REV3LO60673 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
REV3LO60673 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
REV3LO60673 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
REV3LO60673 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
REV3LO60673 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
REV3LO60673 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
REV3LO60673 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
REV3LO60673 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
REV3LO60673 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
REV3LO60673 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
REV3LO60673 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
REV3LO60673 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
REV3LO60673 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
REV3LO60673 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
REV3LO60673 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
REV3LO60673 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
REV3LO60673 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
REV3LO60673 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
REV3LO60673 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
REV3LO60673 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
REV3LO60673 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
REV3LO60673 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
REV3LO60673 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms