Protein–RNA interactions for Protein: O43933

PEX1, Peroxisome biogenesis factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX1O43933 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX1O43933 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX1O43933 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX1O43933 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX1O43933 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX1O43933 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX1O43933 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX1O43933 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX1O43933 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX1O43933 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX1O43933 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX1O43933 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEX1O43933 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEX1O43933 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PEX1O43933 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PEX1O43933 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PEX1O43933 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PEX1O43933 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PEX1O43933 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PEX1O43933 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEX1O43933 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEX1O43933 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEX1O43933 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEX1O43933 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PEX1O43933 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PEX1O43933 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PEX1O43933 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PEX1O43933 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PEX1O43933 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PEX1O43933 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PEX1O43933 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PEX1O43933 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PEX1O43933 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PEX1O43933 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PEX1O43933 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PEX1O43933 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PEX1O43933 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PEX1O43933 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PEX1O43933 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PEX1O43933 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PEX1O43933 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PEX1O43933 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PEX1O43933 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PEX1O43933 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PEX1O43933 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PEX1O43933 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PEX1O43933 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PEX1O43933 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PEX1O43933 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PEX1O43933 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PEX1O43933 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PEX1O43933 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PEX1O43933 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PEX1O43933 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PEX1O43933 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX1O43933 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX1O43933 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX1O43933 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX1O43933 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX1O43933 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX1O43933 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX1O43933 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX1O43933 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEX1O43933 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEX1O43933 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEX1O43933 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEX1O43933 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEX1O43933 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEX1O43933 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEX1O43933 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PEX1O43933 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX1O43933 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX1O43933 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX1O43933 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX1O43933 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX1O43933 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX1O43933 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX1O43933 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX1O43933 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX1O43933 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX1O43933 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX1O43933 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX1O43933 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX1O43933 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX1O43933 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX1O43933 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX1O43933 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX1O43933 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX1O43933 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX1O43933 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX1O43933 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX1O43933 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX1O43933 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX1O43933 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX1O43933 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX1O43933 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX1O43933 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX1O43933 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX1O43933 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX1O43933 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms